《GeroScience》:Knockdown of the fly spliceosome component Rbp1 (orthologue of SRSF1) extends lifespan
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本刊推薦:為探究剪接體在衰老調控中的作用,研究人員通過條件性RNA干擾技術靶向果蠅剪接體核心基因,發(fā)現Rbp1(SRSF1同源基因)敲低可顯著延長壽命,且該效應在成年后期誘導依然有效。該研究首次揭示剪接體作為飲食限制(DR)和mTOR抑制的共同下游樞紐,為抗衰老干預提供了新靶點。
隨著全球人口老齡化加劇,衰老相關疾病的防治已成為生命科學領域的焦點。衰老伴隨著分子水平的復雜變化,其中選擇性剪接(alternative splicing)的失調被認為是關鍵因素之一。選擇性剪接通過調控pre-mRNA(前信使核糖核酸)不同外顯子的組合方式,顯著增加蛋白質組的多樣性,這一過程由剪接體(spliceosome)——一個由近百種蛋白質和snRNP(小核核糖核蛋白)組成的動態(tài)復合物精確調控。既往研究表明,飲食限制(DR)和哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mTOR)抑制這兩種經典延壽干預都能引起剪接體的廣泛重編程,但剪接體本身是否直接調控壽命仍屬未知。
在此背景下,謝菲爾德大學的Dan J. Hayman和Mirre J.P. Simons團隊在《GeroScience》發(fā)表研究,通過整合轉錄組學與遺傳學手段,揭示剪接體組分Rbp1(人SRSF1同源基因)的敲低可跨年齡階段延長果蠅壽命。該研究不僅證實剪接體是衰老調控的關鍵樞紐,更為開發(fā)靶向剪接體的抗衰老療法提供了實驗依據。
研究人員主要采用三種關鍵技術:一是利用daGS(daughterless-GeneSwitch)系統實現成蟲階段特異性基因敲低;二是通過RNA-seq(RNA測序)分析DR和瞬時mTOR抑制下的剪接體轉錄組變化;三是應用Cox比例風險混合效應模型(coxme)進行生存數據分析。果蠅樣本來源于統一遺傳背景的實驗室品系,轉錄組數據源自團隊前期構建的DR和mTOR抑制數據庫。
方法學創(chuàng)新與實驗設計
本研究巧妙結合了條件性基因調控與多組學分析。通過daGS系統實現成蟲階段可誘導的基因敲低,避免了發(fā)育期基因操作對壽命的干擾;利用邊緣R(edgeR)軟件包對RNA-seq數據進行差異表達分析,并通過TopGO進行基因本體富集分析;生存實驗采用籠養(yǎng)(cage-based)設計,以Cox混合效應模型校正環(huán)境偏差,確保統計嚴謹性。
研究結果
剪接體基因在DR與mTOR抑制中一致性表達
對DR和瞬時mTOR抑制的轉錄組分析發(fā)現,剪接體相關基因在兩種干預中均顯著富集(DR:χ2=151.2, p<2.2×10?1?;mTOR抑制:χ2=3287.9, p<2.2×10?1?)。32個剪接體基因在兩種干預下呈現同向表達變化,其中30個基因顯著上調。
個體剪接體組分調控壽命
針對DR與mTOR抑制共同上調的5個核心基因(barc、Prp5、Sf3b1、CG4896、CG7974)進行RNAi敲低,發(fā)現barc、Prp5和Sf3b1敲低導致壽命顯著縮短(p<0.0001),而Rbp1敲低使壽命延長41%(p<0.0001)。
晚期誘導Rbp1敲低仍可延長壽命
為驗證干預的臨床轉化潛力,研究者在果蠅15日齡和25日齡時誘導Rbp1敲低。Cox區(qū)間模型顯示,兩個晚期干預組死亡率風險均顯著降低(15日齡:HR=0.74, p=0.00017;25日齡:HR=0.79, p=0.0059),證明其抗衰老效應與起始年齡無關。
結論與展望
本研究首次證實剪接體組分Rbp1可作為獨立壽命調控靶點,其敲低能模擬DR和mTOR抑制的部分益處。值得注意的是,盡管DR與mTOR抑制均上調Rbp1表達,但其敲低反而延長壽命,提示剪接體可能通過補償性反應參與衰老調控。機制上,Rbp1作為SR蛋白(絲氨酸/精氨酸富集蛋白)在剪接體早期組裝階段發(fā)揮作用,而敲低后存活率下降的基因(Sf3b1、barc、Prp5)均參與剪接體A復合物形成,表明剪接進程的適度減緩而非完全阻滯可能有利于壽命延長。
該研究的突破性在于發(fā)現剪接體調控具有時空普適性:Rbp1敲低在成年后期仍有效,這與終身干預的DR不同,更符合臨床轉化需求。人類SRSF1(Rbp1同源基因)已在細胞重編程篩選中被鑒定為 rejuvenation(年輕化)因子,本研究為其在哺乳動物中的抗衰老應用提供了理論支撐。未來需進一步解析Rbp1調控的下游剪接網絡,以及其與蛋白質穩(wěn)態(tài)(proteostasis)的關聯,為開發(fā)靶向剪接體的精準抗衰老策略奠定基礎。