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利用簡單序列重復(fù)(SSR)標(biāo)記對(duì)中國山楂(Crataegus L.)資源的遺傳多樣性和DNA指紋進(jìn)行分析
《Genetic Resources and Crop Evolution》:Genetic diversity and DNA fingerprinting of Chinese hawthorn (Crataegus L.) resources using simple sequence repeat (SSR) markers
【字體: 大 中 小 】 時(shí)間:2026年01月08日 來源:Genetic Resources and Crop Evolution
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本研究基于SSR標(biāo)記分析82份山楂種質(zhì)資源遺傳多樣性,發(fā)現(xiàn)較高遺傳多樣性(Na=9.727,Ne=3.361,Ho=0.723),通過聚類和核心引物(Pr316、Pr224、Pr454)將其分為4組,不同引物區(qū)分能力差異顯著,為資源保護(hù)和育種提供依據(jù)。
山楂(Crataegus spp.)是一種具有多重園藝價(jià)值的植物,其用途包括食用、藥用、觀賞和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。盡管中國是山楂遺傳多樣性的主要中心,擁有豐富的資源,但這些資源的遺傳多樣性和DNA指紋特征仍缺乏詳細(xì)研究。本研究利用22個(gè)多態(tài)性簡單序列重復(fù)(SSR)標(biāo)記,對(duì)82份山楂樣本(包括80份國內(nèi)樣本和2份國外樣本)的遺傳多樣性、種群結(jié)構(gòu)、主坐標(biāo)分析及DNA指紋特征進(jìn)行了分析。在種群水平上,觀察到的等位基因數(shù)(Na)為9.727,有效等位基因數(shù)(Ne)為3.361,香農(nóng)信息指數(shù)(I)為1.426,觀察到的雜合度(Ho)為0.723,預(yù)期雜合度(He)為0.671,多態(tài)性信息含量(PIC)介于0.304至0.815之間,平均值為0.623,表明這些樣本具有相對(duì)較高的遺傳多樣性。22個(gè)SSR標(biāo)記的鑒定概率(PI)和同胞鑒定概率(PIsibs)分別為3.67×10-19和2.38×10-8,證實(shí)了SSR標(biāo)記在基因指紋鑒定中的強(qiáng)大區(qū)分能力。聚類分析、種群結(jié)構(gòu)和主坐標(biāo)分析(PCoA)將這些樣本共同分為四個(gè)主要組別。此外,還使用5個(gè)核心SSR引物對(duì)這82份樣本進(jìn)行了DNA指紋分析。結(jié)果表明不同引物的區(qū)分能力存在差異:引物Pr316能夠區(qū)分19份樣本,而引物Pr224和Pr454分別能區(qū)分14份和13份樣本。本文分析了迄今未被報(bào)道的中國山楂種質(zhì)的遺傳多樣性,并通過5個(gè)核心SSR標(biāo)記建立了其DNA指紋圖譜,為未來的資源保護(hù)、開發(fā)和育種工作提供了支持。
山楂(Crataegus spp.)是一種具有多重園藝價(jià)值的植物,其用途包括食用、藥用、觀賞和經(jīng)濟(jì)價(jià)值。盡管中國是山楂遺傳多樣性的主要中心,擁有豐富的資源,但這些資源的遺傳多樣性和DNA指紋特征仍缺乏詳細(xì)研究。本研究利用22個(gè)多態(tài)性簡單序列重復(fù)(SSR)標(biāo)記,對(duì)82份山楂樣本(包括80份國內(nèi)樣本和2份國外樣本)的遺傳多樣性、種群結(jié)構(gòu)、主坐標(biāo)分析及DNA指紋特征進(jìn)行了分析。在種群水平上,觀察到的等位基因數(shù)(Na)為9.727,有效等位基因數(shù)(Ne)為3.361,香農(nóng)信息指數(shù)(I)為1.426,觀察到的雜合度(Ho)為0.723,預(yù)期雜合度(He)為0.671,多態(tài)性信息含量(PIC)介于0.304至0.815之間,平均值為0.623,表明這些樣本具有相對(duì)較高的遺傳多樣性。22個(gè)SSR標(biāo)記的鑒定概率(PI)和同胞鑒定概率(PIsibs)分別為3.67×10-19和2.38×10-8,證實(shí)了SSR標(biāo)記在基因指紋鑒定中的強(qiáng)大區(qū)分能力。聚類分析、種群結(jié)構(gòu)和主坐標(biāo)分析(PCoA)將這些樣本共同分為四個(gè)主要組別。此外,還使用5個(gè)核心SSR引物對(duì)這82份樣本進(jìn)行了DNA指紋分析。結(jié)果表明不同引物的區(qū)分能力存在差異:引物Pr316能夠區(qū)分19份樣本,而引物Pr224和Pr454分別能區(qū)分14份和13份樣本。本文分析了迄今未被報(bào)道的中國山楂種質(zhì)的遺傳多樣性,并通過5個(gè)核心SSR標(biāo)記建立了其DNA指紋圖譜,為未來的資源保護(hù)、開發(fā)和育種工作提供了支持。
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