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期待已久!MERFISH超分辨率空間轉錄組學技術服務終于來了!
【字體: 大 中 小 】 時間:2022年09月20日 來源:
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基因集團上海貝晶生物技術有限公司國內首家推出MERFISH超分辨率空間轉錄組學技術服務,歡迎感興趣的研究者咨詢和合作!
超分辨率•亞細胞水平•高靈敏度
基因集團上海貝晶生物技術有限公司國內首家推出MERFISH超分辨率空間轉錄組學技術服務,歡迎感興趣的研究者咨詢和合作!
MERFISH:多重熒光原位雜交
(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)
RNA在細胞中的分布對其表達有很重要的調節作用,因此研究RNA的空間位置有很重要的意義。單分子熒光原位雜交技術(single-molecule FISH,smFISH)是進行原位基因表達檢測的金標準,但其檢測通量較低。
華人科學家美國工程院院士莊小威(哈佛大學)發明了MERFISH(Multiplexed error-robust fluorescence in situ hybridization)多重熒光原位雜交技術,突破了傳統的smFISH的技術通量低的缺陷,可以在單細胞中同時檢測多至500種基因甚至更多。
首家引進
MERSCOPE™超分辨率成像分析系統
2021年,美國Vizgen公司發布了世界上第一款商品化的MERFISH超分辨率成像分析系統MERSCOPE™。2022年基因集團首家引進該平臺,落地上海貝晶生物技術有限公司紫竹高新技術開發區實驗室。
基于核心MERFISH技術,MERSCOPE™可對1cm²的組織進行超分辨成像,分辨率≤100納米,定位單細胞中RNA的空間分布以及定量基因表達。實現真正意義上的原位單細胞空間基因組分析,讓基因的表達和定位可視化,推動基因組學的研究步入下一代!
MERFISH空間轉錄組技術的優勢
1. 空間分辨率高:≤100nm分辨率,在亞細胞水平上定位RNA轉錄本
2. 靈敏度高:無需測序,能檢測到其它方法檢測不到的低表達基因
3. 高度多重:客戶自定義gene panel設計,目前最多500個基因,后續會升級到1000 gene panel
4. 多樣本適用性:目前適用于新鮮的/固定冰凍的超薄組織切片、細胞涂片等,短期內會實現FFPE樣本方案
5. 多種應用:涉及腫瘤學、免疫學、神經生物學、感染性疾病、發育生物學&再生醫學、藥物開發、細胞和基因治療等多個研究領域。
交互式軟件&可視化數據
可視化MERFISH數據的交互式軟件MERSCOPE Vizualizer™,可產生包括細胞分區分析、檢測到的轉錄本和高分辨率圖像,所得數據兼容第三方軟件分析。
專業的數據分析團隊可為您提供標注特定基因的細胞群體聚類結果。
MERFISH技術文章舉例
Stogsdill, Jeffrey A et al. “Pyramidal neuron subtype diversity governs microglia states in the neocortex.” Nature vol. 608,7924 (2022): 750-756. doi:10.1038/s41586-022-05056-7
Fang, Rongxin et al. “Conservation and divergence of cortical cell organization in human and mouse revealed by MERFISH.” Science (New York, N.Y.) vol. 377,6601 (2022): 56-62. doi:10.1126/science.abm1741
De Luca, Roberto et al. “Orexin neurons inhibit sleep to promote arousal.” Nature communications vol. 13,1 4163. 18 Jul. 2022, doi:10.1038/s41467-022-31591-y
Zhang, Meng et al. “Spatially resolved cell atlas of the mouse primary motor cortex by MERFISH.” Nature vol. 598,7879 (2021): 137-143. doi:10.1038/s41586-021-03705-x
Favuzzi, Emilia et al. “GABA-receptive microglia selectively sculpt developing inhibitory circuits.” Cell vol. 184,15 (2021): 4048-4063.e32. doi:10.1016/j.cell.2021.06.018
Lu, Yanfang et al. “Spatial transcriptome profiling by MERFISH reveals fetal liver hematopoietic stem cell niche architecture.” Cell discovery vol. 7,1 47. 29 Jun. 2021, doi:10.1038/s41421-021-00266-1
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基因集團上海貝晶生物技術有限公司全國首家推出MERSCOPE™ MERFISH空間基因組學技術服務。
基因集團基因有限公司為美國Vizgen公司MERSCOPE™多重FISH超分辨率成像分析系統中國總代理。
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