10x Genomics公司近日宣布正式發(fā)售Chromium單細(xì)胞多組學(xué)ATAC + 基因表達(dá)解決方案，該產(chǎn)品能夠同時(shí)對(duì)同一單細(xì)胞開(kāi)展表觀基因組和轉(zhuǎn)錄組分析。通過(guò)這種多組學(xué)方法，研究人員可以將細(xì)胞的表觀遺傳程序與轉(zhuǎn)錄圖譜相關(guān)聯(lián)，從而更好地了解細(xì)胞功能。

Chromium單細(xì)胞多組學(xué)ATAC + 基因表達(dá)解決方案帶來(lái)了細(xì)胞的基因表達(dá)譜及其表觀基因組景觀的一體化視圖。它同時(shí)采用兩種模式，能夠提高細(xì)胞狀態(tài)的分辨率，鑒定差異基因表達(dá)的驅(qū)動(dòng)因素，并發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄圖譜相似但染色質(zhì)景觀功能不同的細(xì)胞。

據(jù)介紹，這種多組學(xué)分析有助于了解腫瘤異質(zhì)性的驅(qū)動(dòng)因素、治療耐藥的機(jī)制以及與神經(jīng)退行性或免疫性疾病相關(guān)的細(xì)胞類型。

這個(gè)新的解決方案是基于10x Genomics今年推出的一系列新產(chǎn)品，包括適用于單細(xì)胞分析的Chromium平臺(tái)以及適用于空間基因組學(xué)的Visium平臺(tái)。目前已有多名客戶試用了Chromium單細(xì)胞多組學(xué)ATAC + 基因表達(dá)，包括斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院、西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院和西班牙國(guó)家基因組分析中心。

斯坦福大學(xué)醫(yī)學(xué)院的病理學(xué)助理教授Ansuman Satpathy博士表示：“我的實(shí)驗(yàn)室很想了解為什么有些免疫細(xì)胞無(wú)法對(duì)抗癌癥。我們計(jì)劃使用10x Genomics的新產(chǎn)品來(lái)了解免疫細(xì)胞功能缺陷的表觀遺傳和轉(zhuǎn)錄調(diào)控，并在將來(lái)利用此信息來(lái)設(shè)計(jì)更精準(zhǔn)有效的免疫療法。”

西班牙國(guó)家基因組分析中心的單細(xì)胞基因組學(xué)團(tuán)隊(duì)負(fù)責(zé)人Holger Heyn博士正在研究B細(xì)胞分化和激活的機(jī)制。他表示：“之前，我們一直依靠計(jì)算機(jī)預(yù)測(cè)將細(xì)胞的表觀基因組與單細(xì)胞基因表達(dá)譜相匹配。10x Genomics的多組學(xué)分析讓我們能夠直接測(cè)定以往只能預(yù)測(cè)的內(nèi)容，并且能夠確認(rèn)這些預(yù)測(cè)的準(zhǔn)確性如何。”

西奈山伊坎醫(yī)學(xué)院的遺傳學(xué)和基因組學(xué)副教授Panagiotis Roussos博士談到：“通過(guò)這項(xiàng)新技術(shù)，我們可以更好地了解各種神經(jīng)精神疾病中的非編碼遺傳變異的作用機(jī)制，包括阿爾茨海默病、帕金森病、精神分裂癥、雙相情感障礙和重度抑郁癥。”

有了Chromium單細(xì)胞多組學(xué)ATAC + 基因表達(dá)，研究人員能夠：

▪ 通過(guò)轉(zhuǎn)錄和表觀基因組的關(guān)聯(lián)分析來(lái)加深其對(duì)細(xì)胞類型和狀態(tài)的鑒定
▪ 發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)錄圖譜相似但染色質(zhì)景觀功能不同的細(xì)胞
▪ 探索細(xì)胞分化、發(fā)育和疾病背后的基因調(diào)控相互作用
▪ 使用關(guān)鍵的表達(dá)標(biāo)志物來(lái)輕松解釋表觀遺傳圖譜
▪ 通過(guò)同一細(xì)胞的多個(gè)讀數(shù)，從寶貴樣本中獲得最大量的信息

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