對于基因表達研究來說，空間一直都是具有挑戰性的前沿領域。空間基因表達對于理解組織中細胞的身份和功能至關重要，但常規的工具無法有效地捕獲這些信息。因此，細胞機制中的一些重要細節在研究過程中丟失了。近兩年，空間基因組學和空間轉錄組學快速發展，出現了不少新工具。

NanoString生物公司的GeoMx 數字化空間分析系統（GeoMx Digital Spatial Profiler）將空間和分子分析技術相結合，能夠以單細胞分辨率生成組織圖像，同時生成RNA或蛋白分析物的分析數據。這種高通量的空間多組學分析讓研究人員能夠快速評估組織樣本中的細胞異質性。

GeoMx Digital Spatial Profiler采用獨家專利技術在抗體或者RNA上偶聯DNA Oligo。每個DNA Oligo對應一個靶標。當抗體或RNA與組織上的靶標結合后，GeoMx Digital Spatial Profiler利用紫外光切斷DNA oligo與抗體或RNA之間的連接物，從而釋放出DNA Oligo以進行下一步定量。

多靶標

GeoMx Digital Spatial Profiler一天之內可處理多達12塊組織切片。它能夠對更多靶標（> 20,000個）和更多分析物（RNA和蛋白）進行分析，從而讓您更快獲得可發表的數據。

多區域

在保留組織樣本完整性的情況下，GeoMx Digital Spatial Profiler可允許使用者在單張載玻片上根據組織輪廓選擇感興趣的區域（Region Of Interest），甚至選取稀有細胞群體進行分析。選擇模式是多種多樣的，可根據形狀或標志物等。

多樣本

與新鮮冷凍切片兼容，也與福爾馬林固定石蠟包埋（FFPE）樣本兼容，同時也允許使用組織芯片（TMA）。這樣，您的研究不再受樣本類型的限制，可以開展更廣泛的研究。

自動化的工作流程

應用

不久前有兩項使用GeoMx Digital Spatial Profiler的研究發表在《Nature》雜志上。MD安德森癌癥中心的Jennifer Wargo團隊和瑞典隆德大學的Göran Jönsson團隊分別用GeoMx DSP證明了三級淋巴結構（Teritiary Lymphoid Structure）在腫瘤免疫反應中起到重要作用。三級淋巴結構是在慢性炎癥和腫瘤發生過程中在非淋巴組織上形成的異位淋巴器官，其結構和功能類似于淋巴結和脾臟等二級淋巴器官。

此外，兩個團隊都通過空間多組學技術，提供了基于三級淋巴結構的新型分子標志物，并對過往大量的黑色素瘤臨床數據進行分析，為三級淋巴結構的密度和病人生存期的關系提供了強而有力的證據。