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基因組檢測的藍寶石——Bionano Saphyr™,為您帶來更多的眼見為實
【字體: 大 中 小 】 時間:2017年12月20日 來源:
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美國Bionano Genomics公司于2017年發布了新一款單分子光學圖譜檢測系統——Saphyr™。相比同樣用了納米微流控芯片技術的Irys®系統,Saphyr™具有更高的通量,以及更快的檢測速度,對于大的結構變異的檢測有著特殊的靈敏度,因而能夠更加特異性的揭示基因組真實結構。
美國Bionano Genomics公司于2017年發布了新一款單分子光學圖譜檢測系統——Saphyr™。相比同樣用了納米微流控芯片技術的Irys®系統,Saphyr™具有更高的通量,以及更快的檢測速度,對于大的結構變異的檢測有著特殊的靈敏度,因而能夠更加特異性的揭示基因組真實結構。

Bionano的下一代圖譜技術(Next-Generation Mapping,NGM)是一種基于納米微流控芯片的技術。利用光蝕刻技術在芯片上生成結構細微巧妙的微流控管路(如下圖),其中含有數以萬計直徑約50nm的細小通道,這些納米級通道(Nanochannel)作用是能夠保證流經過的DNA為單個DNA分子并處于線性伸展的狀態,便于檢測系統完成單分子基因圖譜。

目前,這一技術已經在基因組組裝、結構變異檢測等領域受到了廣泛的認可。通過繪制基因組中單分子基因圖譜,能夠分析小至幾十kb的SV及CNV,輔助來自NGS的短讀長的測序數據進行高質量的組裝分析。結合長讀長的PacBio SMRT測序技術,不僅可以用于不同片段大小的結構變異分析,還可以用于打造接近完美的參考基因組,揭示更多來自基因組中的“暗物質”,可謂是基因組研究領域中的黃金組合!
與上一款產品Irys®不同,Saphyr™采用了高通量的納米微流控芯片,使得*大的通量可以達到每張芯片640Gb。通量的提升不僅降低了檢測的成本,還使得檢測速度有了大幅的提升,從樣本準備到結構變異檢測或者是基因組scaffold拼接,只需要短短5天時間。

新產品Saphyr™的推出,使得Bionano的NGM技術可以在基因組研究領域中得到更加廣泛的應用:
無法診斷的遺傳疾病——通過檢測NGS所遺失的大的結構變異來彌補診斷中面臨的gap。
基因的發現和治療手段的研發——識別感興趣的基因,及其位置與結構變化如何對它們造成影響,為研發有效的治療手段提供幫助。
癌癥研究——可視化的檢測癌癥基因組中發生的大型重排
細胞系研究——監測細胞系基因組的完整性,并檢測基因工程中產生的脫靶效應。
選擇性育種——在動植物育種過程中,鑒定可實現理想性狀的基因組中感興趣的區域。
進化生物學——了解基因組如何進化和重組的整個過程。
參考基因組組裝——完成基因組組裝并且對測序數據的組裝進行準確的校正。
