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        QIAGEN推出‘數字NGS’新產品[新品推薦]

        【字體: 時間:2016年08月05日 來源:生物通

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          QIAGEN公司近日宣布推出一套新穎的新一代測序集合產品。這些QIAseq NGS panel是基于專有的數字NGS技術,對DNA、RNA和miRNA實現無偏向的準確定量。

        生物通報道 QIAGEN公司近日宣布推出一套新穎的新一代測序集合產品。這些QIAseq NGS panel是基于專有的數字NGS技術,對DNA、RNA和miRNA實現無偏向的準確定量。

        何謂數字NGS技術?它利用一種獨特的分子索引技術(Molecular Index Technology),在所有測序平臺上實現更準確的變異定量和檢測。這種技術既適用于QIAGEN的GeneReader NGS系統,也同樣適用于Illumina的MiSeq、NextSeq和HiSeq系統,以及賽默飛世爾的Ion PGM和Ion S5系統。

        隨著轉化和臨床研究逐漸投入NGS的懷抱,問題也應運而生。有時候,樣品很有限,或核酸被降解。由于PCR擴增偏向的存在,在定量稀有轉錄本時,這些問題可能導致實驗失敗。數字NGS利用獨特分子索引(UMI)來標記樣品中的每個分子,以避免PCR誘導的擴增偏向和文庫構建偏向。

        與先進的引物設計和專利的檢測技術相結合,QIAseq Targeted panel實現了稀有(低頻)突變的可靠檢測,以及富含GC區域的高效測序。此外,這種方法可準確鑒定其他方法往往無法檢測的遺傳變異。這些功能滿足了之前無法滿足的客戶需求。

        QIAGEN此次推出了四種新一代測序集合,包括:

        • QIAseq Targeted DNA Panel – 結合UMI和獨特技術來可靠檢測低頻的基因變異,并訪問富有挑戰性的基因組區域,包括富含GC的區域。
        • QIAseq Targeted RNAscan Panel – 將UMI融入RNA文庫的測序中,實現已知和新穎基因融合的更靈敏檢測。
        • QIAseq miRNA NGS Kit – 解決流程中的主要問題,帶來高質量的數字NGS和無偏向的定量
        • QIAseq Targeted RNAseq Kit – 利用UMI來準確定量最多1000個目標的基因表達

        也許有人關心這個系統的靈敏度如何。若是新鮮樣品,可使用1 ng至25 ng RNA來構建文庫,若是FFPE樣品(假設90%的樣品嚴重降解或交聯),可使用100 ng至250 ng來構建文庫。當然,如果你的目標比較罕見,QIAGEN建議使用最大量。

        除了預先設計的DNA和RNA panel,QIAGEN還宣布推出panel定制設計服務,讓客戶能擴展分析內容。這種服務是基于QIAGEN多年提供預驗證內容的經驗,目前已覆蓋6萬多個基因目標。

        “即使是最困難的組織以及液體活檢樣品,QIAseq targeted panel也能帶來可靠的NGS結果,讓研究人員能夠探索最深層的遺傳變異,產生寶貴的分子見解。利用這種新穎的方法,QIAGEN正推出一整套NGS產品組合,”QIAGEN生命科學部門的副總裁Brad Crutchfield談道。(生物通 余亮)

        我想深入了解QIAGEN的數字NGS技術及相關產品

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