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        組蛋白抗體數據庫助你選購抗體

        【字體: 時間:2015年07月28日 來源:生物通

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          選購抗體一直是件勞心勞力的事情。搜索比較,查找文獻,還不一定可靠。如今,一個新的數據庫也許能消除你的煩惱。這個名為Histone Antibody Specificity Database的網站提供了經過驗證的檢測結果,讓研究人員能夠獲得和比較真實世界的數據,并挑選最可靠的抗體。

          

        選購抗體一直是件勞心勞力的事情。搜索比較,查找文獻,還不一定可靠。如今,一個新的數據庫也許能消除你的煩惱。這個名為Histone Antibody Specificity Database的網站提供了經過驗證的檢測結果,讓研究人員能夠獲得和比較真實世界的數據,并挑選最可靠的抗體。近日,一篇發表在《Molecular Cell》上的文章介紹了這個數據庫。

        “我無法想象有任何生物醫學研究不依賴抗體;它們通常是許多研究中的關鍵,”北卡羅萊納大學醫學院的Brian D. Strahl教授談道,他也是這篇文章的通訊作者之一。“但是,這些工具有多可靠?生物界逐漸認識到,我們需要更好的方式來了解抗體。這也是我們建立這個網站的目的。”

        這個網站(http://www.histoneantibodies.com)主要關注組蛋白的抗體,這屬于新興的表觀遺傳學研究領域的一部分。表觀遺傳學研究人員研究基因組外的信息如何控制基因的“開”和“關”,就像電燈開關一樣,這反過來又影響人類健康的方方面面。研究人員利用組蛋白抗體來追蹤各種蛋白在基因調控中的作用。

        每個組蛋白抗體被認為與特定的蛋白目標結合,讓科學家能夠追蹤健康和患病細胞中的蛋白如何被調節。然而,人們也發現,一些抗體與主要目標之外的其他蛋白結合,而一些抗體雖只與一個蛋白結合,但并非理想中的目標。在某些情況下,抗體的準確性和特異性隨批次而變化,表明質量控制存在問題。

        新的數據庫提供了100多種常用的組蛋白抗體的準確性和特異性的信息。它所使用的檢測方法是基于Strahl及其同事開發的肽段芯片。此芯片呈現了組蛋白上已知的所有化學修飾或“標簽”。通過分析,他們能迅速弄清每個抗體能與哪種類型的標簽結合。這相當重要。每個標簽被認為具有不同的功能。

        肽段芯片平臺的消息傳出去之后,Strahl及其同事就經常接到其他科學家的電話,咨詢如何選擇抗體。這激起了研究小組的想法:何不購買所有常用的組蛋白抗體,在芯片上檢驗它們,并在一個網站上公布結果?

        這個網站允許用戶利用多個參數搜索抗體。Strahl表示,他希望此數據庫能夠帶來更準確、更具重復性的表觀遺傳學成果。“你不要指望每個抗體都是完美的,但我們希望研究人員能知道它的缺陷是什么,”Strahl說。“這樣,至少人們能夠謹慎地解釋他們的結果。”(生物通 薄荷)

        原文檢索

        An Interactive Database for the Assessment of Histone Antibody Specificity

        Molecular Cell  DOI: http://dx.doi.org/10.1016/j.molcel.2015.06.022

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