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外周血循環(huán)exosome lncRNA測(cè)序
【字體: 大 中 小 】 時(shí)間:2015年04月28日 來(lái)源:銳博生物
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銳博生物在全球領(lǐng)先研發(fā)出外周血循環(huán)exosome RNA富集和提取技術(shù),并結(jié)合微量RNA建庫(kù)測(cè)序技術(shù),提供外周血循環(huán)exosome lncRNA研究整體解決方案,為廣大的生物醫(yī)學(xué)研究提供最前沿和高質(zhì)量的技術(shù)服務(wù)。
exosome來(lái)源于晚期核內(nèi)體(也稱(chēng)為多囊泡體)的囊泡,是由活細(xì)胞分泌的而來(lái),是一類(lèi)大小介于30-100nm的含有RNA和蛋白質(zhì)的微囊,幾乎所有類(lèi)型的細(xì)胞都能分泌,廣泛存在于各種體液中,特別是存在于外周血循環(huán)系統(tǒng)。目前的研究發(fā)現(xiàn)外周血循環(huán)exosome包含有蛋白質(zhì)、脂質(zhì),還有種類(lèi)豐富的各類(lèi)核酸分子,特別miRNA、piRNA和lncRNA。這些核酸分子被exosome的脂膜所包裹和保護(hù),在細(xì)胞間通信中發(fā)揮重要的生物學(xué)功能,并有望成為液體活檢的重要分子標(biāo)志物。

外周血循環(huán)RNA存在形式示例圖
銳博生物在全球領(lǐng)先研發(fā)出外周血循環(huán)exosome RNA富集和提取技術(shù),并結(jié)合微量RNA建庫(kù)測(cè)序技術(shù),提供外周血循環(huán)exosome lncRNA研究整體解決方案,為廣大的生物醫(yī)學(xué)研究提供最前沿和高質(zhì)量的技術(shù)服務(wù)。
通過(guò)exosome lncRNA測(cè)序技術(shù),具有以下醫(yī)學(xué)意義:
• 開(kāi)發(fā)針對(duì)復(fù)雜疾病的無(wú)創(chuàng)早期檢測(cè)標(biāo)志物,提高診斷的特異性和靈敏性;
• 指導(dǎo)針對(duì)復(fù)雜疾病特別是腫瘤的個(gè)性化治療;
• 用于疾病的預(yù)后判斷,特別是循環(huán)系統(tǒng)疾病和腫瘤
服務(wù)流程

測(cè)序方案
1) 測(cè)序平臺(tái):Illumina HiSeq 3000/2500
2) 測(cè)序模式:PE150/PE100
3) 測(cè)序數(shù)據(jù)量:每個(gè)樣本10G clean data
適用物種:人、大鼠、小鼠
樣本類(lèi)型:血清或血漿
分析內(nèi)容
1. 去除接頭序列及低質(zhì)量reads的處理
2. 測(cè)序質(zhì)量評(píng)估
3. 參考基因組比對(duì)
4. 全基因組reads分布圖譜
5. RNA均一性分析
6. RNA序列完整性分析
7. mRNA一:已知mRNA鑒定
8. mRNA二:mRNA表達(dá)量計(jì)算及樣品間表達(dá)差異分析
9. mRNA三:差異基因KEGG生物通路富集分析
10. mRNA四:差異基因GO功能富集分析
11. lncRNA一:已知lncRNA鑒定
12. lncRNA二:計(jì)算已知lncRNA表達(dá)量及樣品間lncRNA表達(dá)差異分析
13. lncRNA三:預(yù)測(cè)新lncRNA
14. lncRNA四:計(jì)算新lncRNA表達(dá)量及樣品間新lncRNA表達(dá)差異分析
銳博實(shí)測(cè)數(shù)據(jù)展示
實(shí)測(cè)樣本:某份人血清e(cuò)xosome lncRNA

檢測(cè)結(jié)果中:
編碼基因約7000個(gè);lncRNA基因約3000個(gè);
mRNA轉(zhuǎn)錄本約10000個(gè),lncRNA轉(zhuǎn)錄本約5000個(gè)
新lncRNA檢測(cè):可檢測(cè)出超過(guò)2000新lncRNA轉(zhuǎn)錄本

基因完整度檢測(cè):橫軸為轉(zhuǎn)錄本度覆蓋度,縱軸為轉(zhuǎn)錄本所占比例

轉(zhuǎn)錄本覆蓋均一性/偏好性檢測(cè)
說(shuō)明:reads在轉(zhuǎn)錄本上分布較為均一,無(wú)3’或5’偏好性
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