著名的基因組網(wǎng)站www.GenomeWeb.com，選取了31只與生命科學(xué)組學(xué)研究及分子診斷相關(guān)的上市公司股票，編制了自己的GenomeWeb Index，突然發(fā)現(xiàn)9月底以來，其中股價(jià)出現(xiàn)異動(dòng)，其中PacBio的股票價(jià)格在一個(gè)月之內(nèi)（9月30日—10月30日）幾乎翻倍，每股價(jià)格從$3.66飆升至$7.10，原先生物界*亮的那顆星，某某資深測(cè)序公司股價(jià)則跌了近20%，難道發(fā)生了什么大事？
 
原來，2015年9月30日，PacBio第三代測(cè)序儀推出*新型號(hào)Sequel以及10月6日在ASHG上首次亮相，吸引了全球生物界的目光，引發(fā)了資本市場(chǎng)和生物技術(shù)市場(chǎng)的軒然大波。

這究竟是一款怎樣的測(cè)序儀，具有如此強(qiáng)大的實(shí)力和市場(chǎng)認(rèn)可度？

在過去一個(gè)月內(nèi)，測(cè)序業(yè)界討論*多的莫過于PacBio公司推出了體積更小，重量更輕，數(shù)據(jù)通量更高，實(shí)驗(yàn)成本更低的新型號(hào)Sequel單分子測(cè)序儀。這一款測(cè)序儀相較于之前的大塊頭RS II系統(tǒng)瘦身不少，其體積和重量?jī)H為過去的1/3左右，這也為實(shí)驗(yàn)室空間不足而頭疼的用戶帶來了希望，儀器價(jià)格也下降不少，不少粉絲可以提前擁有了。

Sequel是如何成功瘦身的呢？首先，Sequel仍然采用PacBio的經(jīng)典技術(shù)SMRT（Single Molecule Real-Time Sequencing），不同之處在于，原來為了檢測(cè)SMRT Cells上面的15萬個(gè)ZMWs（Zero-Mode Waveguide, 零模波導(dǎo)孔）中的熒光，需要龐大的激光光路及檢測(cè)系統(tǒng)，以便同時(shí)拍攝15萬個(gè)ZMW孔中的熒光變化。而在新的Sequel系統(tǒng)上，這一部分光路檢測(cè)系統(tǒng)被內(nèi)置于SMRT Cells之中，從而節(jié)約了大量?jī)x器空間，而且擴(kuò)展到了100萬個(gè)ZMWs。

 
另一方面，在節(jié)約了大量的光學(xué)檢測(cè)部件的空間以后，原來外置的數(shù)據(jù)處理器Blade Center與主機(jī)合二為一，內(nèi)置于下部空間，成為一個(gè)整體，其體積減小至只有原來的1/3。相對(duì)于Illumina Hiseq的體積也小11%。重量也從過去的一噸多到現(xiàn)在的不足400kg，再也不用為自己的樓板擔(dān)心了。

 
原來的PacBio RS II尺寸圖

 
現(xiàn)在的Sequel 尺寸圖

僅僅瘦身是不夠的，Sequel還有更大的驚喜給我們。在延續(xù)SMRT技術(shù)的同時(shí)，保持了長(zhǎng)讀長(zhǎng)（平均10-15k）能力和出色的一致性準(zhǔn)確率（30×coverage, QV 50）。因?yàn)閆MWs數(shù)量從15萬提升至100萬，每個(gè)Cell的產(chǎn)出數(shù)據(jù)通量也有了7倍左右的提升。采用目前的P6-C4試劑，平均每個(gè)SMRT Cell可產(chǎn)生5-10Gb的數(shù)據(jù)，按每個(gè)Gb的數(shù)據(jù)產(chǎn)出成本顯著降低。

更為重要的是，除了成本的降低，Sequel給用戶帶來的是運(yùn)行時(shí)間大幅減少。同樣的時(shí)間，更低的成本，卻可以獲得7倍的數(shù)據(jù)量，無論對(duì)于科研平臺(tái)還是服務(wù)平臺(tái)，都是相當(dāng)驚人的測(cè)序能力提升。以基因組大小為1G的樣本為例，做30×的De novo Assembly，過去需要30個(gè)Cell左右，也就是儀器要Run兩輪，而現(xiàn)在*多只需要4--5個(gè)Cell即可。這對(duì)于快速完成測(cè)序工作而言，無疑是個(gè)重大提升。以后用三代測(cè)序，再也不用領(lǐng)號(hào)排隊(duì)了！

在硬件和試劑耗材上的改變，使得Sequel的性能令人刮目相看，而配套的軟件也是與時(shí)俱進(jìn)。在Sequel系統(tǒng)中，采用了全新的SMRTLink軟件界面，包含Sample Setup, Run Design, Run QC, Data Management以及SMRTAnalysis等模塊。不同顏色代表不同模塊，從樣本設(shè)置，實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)，質(zhì)控，數(shù)據(jù)管理以及多種應(yīng)用的數(shù)據(jù)分析一應(yīng)俱全。

• 在數(shù)據(jù)分析方面，提供不同的用戶界面，比如GUI, cmd, APIs
• 全新的算法應(yīng)用于多種全新應(yīng)用，比如：病毒基因組，稀有變異檢測(cè)，16SrRNA測(cè)序采用CCS2可以獲得顯著的準(zhǔn)確性提升，對(duì)于de novo Assembly采用HGAP4可在高性能服務(wù)器上處理50×人類基因組的數(shù)據(jù)
• 采用行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)，使用BAM文件格式輸入和輸出數(shù)據(jù)
• 分析速度提升—流暢的分析流程，高效利用計(jì)算機(jī)資源
• 同時(shí)，在DevNet您還可以在軟件社區(qū)與全球頂級(jí)的生物信息學(xué)家合作開發(fā)更多的工具。第三方數(shù)據(jù)分析軟件也在不斷為PacBio開發(fā)可靠的全套分析流程方案。

PacBio瘦身成功，華麗亮相，Smaller,Lighter，Smarter, and Much Stronger，更小，更輕，更快，更強(qiáng)，她的能力還遠(yuǎn)遠(yuǎn)超出你的想象，想要了解更多，請(qǐng)咨詢PacBio在中國的獨(dú)家代理商基因有限公司銷售人員。

歡迎索取Sequel單分子測(cè)序儀的詳細(xì)資料