著名的基因組網站www.GenomeWeb.com，選取了31只與生命科學組學研究及分子診斷相關的上市公司股票，編制了自己的GenomeWeb Index，突然發現9月底以來，其中股價出現異動，其中PacBio的股票價格在一個月之內（9月30日—10月30日）幾乎翻倍，每股價格從$3.66飆升至$7.10，原先生物界*亮的那顆星，某某資深測序公司股價則跌了近20%，難道發生了什么大事？
 
原來，2015年9月30日，PacBio第三代測序儀推出*新型號Sequel以及10月6日在ASHG上首次亮相，吸引了全球生物界的目光，引發了資本市場和生物技術市場的軒然大波。

這究竟是一款怎樣的測序儀，具有如此強大的實力和市場認可度？

在過去一個月內，測序業界討論*多的莫過于PacBio公司推出了體積更小，重量更輕，數據通量更高，實驗成本更低的新型號Sequel單分子測序儀。這一款測序儀相較于之前的大塊頭RS II系統瘦身不少，其體積和重量僅為過去的1/3左右，這也為實驗室空間不足而頭疼的用戶帶來了希望，儀器價格也下降不少，不少粉絲可以提前擁有了。

Sequel是如何成功瘦身的呢？首先，Sequel仍然采用PacBio的經典技術SMRT（Single Molecule Real-Time Sequencing），不同之處在于，原來為了檢測SMRT Cells上面的15萬個ZMWs（Zero-Mode Waveguide, 零模波導孔）中的熒光，需要龐大的激光光路及檢測系統，以便同時拍攝15萬個ZMW孔中的熒光變化。而在新的Sequel系統上，這一部分光路檢測系統被內置于SMRT Cells之中，從而節約了大量儀器空間，而且擴展到了100萬個ZMWs。

 
另一方面，在節約了大量的光學檢測部件的空間以后，原來外置的數據處理器Blade Center與主機合二為一，內置于下部空間，成為一個整體，其體積減小至只有原來的1/3。相對于Illumina Hiseq的體積也小11%。重量也從過去的一噸多到現在的不足400kg，再也不用為自己的樓板擔心了。

 
原來的PacBio RS II尺寸圖

 
現在的Sequel 尺寸圖

僅僅瘦身是不夠的，Sequel還有更大的驚喜給我們。在延續SMRT技術的同時，保持了長讀長（平均10-15k）能力和出色的一致性準確率（30×coverage, QV 50）。因為ZMWs數量從15萬提升至100萬，每個Cell的產出數據通量也有了7倍左右的提升。采用目前的P6-C4試劑，平均每個SMRT Cell可產生5-10Gb的數據，按每個Gb的數據產出成本顯著降低。

更為重要的是，除了成本的降低，Sequel給用戶帶來的是運行時間大幅減少。同樣的時間，更低的成本，卻可以獲得7倍的數據量，無論對于科研平臺還是服務平臺，都是相當驚人的測序能力提升。以基因組大小為1G的樣本為例，做30×的De novo Assembly，過去需要30個Cell左右，也就是儀器要Run兩輪，而現在*多只需要4--5個Cell即可。這對于快速完成測序工作而言，無疑是個重大提升。以后用三代測序，再也不用領號排隊了！

在硬件和試劑耗材上的改變，使得Sequel的性能令人刮目相看，而配套的軟件也是與時俱進。在Sequel系統中，采用了全新的SMRTLink軟件界面，包含Sample Setup, Run Design, Run QC, Data Management以及SMRTAnalysis等模塊。不同顏色代表不同模塊，從樣本設置，實驗設計，質控，數據管理以及多種應用的數據分析一應俱全。

• 在數據分析方面，提供不同的用戶界面，比如GUI, cmd, APIs
• 全新的算法應用于多種全新應用，比如：病毒基因組，稀有變異檢測，16SrRNA測序采用CCS2可以獲得顯著的準確性提升，對于de novo Assembly采用HGAP4可在高性能服務器上處理50×人類基因組的數據
• 采用行業標準，使用BAM文件格式輸入和輸出數據
• 分析速度提升—流暢的分析流程，高效利用計算機資源
• 同時，在DevNet您還可以在軟件社區與全球頂級的生物信息學家合作開發更多的工具。第三方數據分析軟件也在不斷為PacBio開發可靠的全套分析流程方案。

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