生物通報道：最近，加州大學（UCLA）洛杉磯分校Eli and Edythe Broad再生醫學和干細胞研究中心的科學家們，在一部分知之甚少的基因組中發現了超過3000個未知基因。這些基因存在于骨髓和胸腺中的稀有細胞中，讓科學家們對“人類免疫系統如何發展”有了一個新的理解。相關研究結果發表在最近的免疫學國際頂級期刊《Nature Immunology》。

本文共同資深作者、UCLA Broad干細胞研究中心聯合主任Gay Crooks指出：“我們發現的基因，被稱為長非編碼RNA（LncRNAs）。它們包含有我們基因組中的大部分“暗物質”，因為不同于十分熟悉的信使RNA基因，它們不產生蛋白質。LncRNA的功能雖不知名，但越來越明顯的是，它們不是惰性的；它們在控制其他基因功能的過程中，發揮關鍵作用。”延伸閱讀：國際知名學者綜述：LncRNA分類。

研究人員使用UCLA Broad干細胞研究中心最先進的細胞分離和基因測序技術以及先進的生物信息學，來鑒定難以捉摸的LlncRNA基因。這個研究小組是由Crooks、共同資深作者、Chintan Parekh（現在在兒童醫院洛杉磯）和第一作者David Casero帶領完成的。

研究人員從成人骨髓和胸腺組織中分離出罕見的造血干細胞和祖細胞。然后，他們用測序技術分離細胞中的遺傳信息。最后，Casero應用生物信息學——使用復雜軟件來收集和了解生物數據的一種方法，來識別和分析細胞中的LncRNAs。

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UCLA病理學和實驗室醫學系的助理研究員Casero說：“我們的研究結果是令人興奮的，因為它們為整個免疫學研究領域，提供了一個巨大的、獨特的資源。我們現在能夠深入探討免疫細胞發育每個階段上最重要的特定lncRNA基因，并了解它們如何單獨和共同起作用，來控制這個過程。”

LncRNA的發現是獨特的，因為它們不產生蛋白質，不同于其他研究中已被研究更徹底的基因。雖然該研究小組研究的干細胞和祖細胞，構成了骨髓和胸腺的不到百分之1，但是它們包含的基因，對于產生免疫系統的細胞，是至關重要的。

Crooks也是David Geffen醫學院和UCLA兒童發現和創新研究院的教授，他說：“如果我們能了解生命過程中免疫系統是如何產生并維持的，我們就可以找到某種方法，提高免疫細胞的生產，用于化療、放療和骨髓移植后的治療方法，或用于治療HIV感染者和遺傳性免疫缺陷患者。此外，通過了解控制這個過程的基因，我們可以更好地了解在癌癥中它們是如何改變的，如白血病和淋巴瘤。”

（生物通：王英）

生物通推薦原文摘要：
Long non-coding RNA profiling of human lymphoid progenitor cells reveals transcriptional divergence of B cell and T cell lineages
Abstract: To elucidate the transcriptional 'landscape' that regulates human lymphoid commitment during postnatal life, we used RNA sequencing to assemble the long non-coding transcriptome across human bone marrow and thymic progenitor cells spanning the earliest stages of B lymphoid and T lymphoid specification. Over 3,000 genes encoding previously unknown long non-coding RNAs (lncRNAs) were revealed through the analysis of these rare populations. Lymphoid commitment was characterized by lncRNA expression patterns that were highly stage specific and were more lineage specific than those of protein-coding genes. Protein-coding genes co-expressed with neighboring lncRNA genes showed enrichment for ontologies related to lymphoid differentiation. The exquisite cell-type specificity of global lncRNA expression patterns independently revealed new developmental relationships among the earliest progenitor cells in the human bone marrow and thymus.