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劉淮教授Plos One利用Arraystar LncRNA芯片研究先兆子癇
【字體: 大 中 小 】 時間:2015年01月12日 來源:康成生物
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江西省婦幼保健院劉淮教授長期從事高危妊娠,難產,婦科腫瘤,婦科炎癥,婦科內分泌的診治和基礎研究。帶領研究小組首次利用Arraystar Human LncRNA芯片研究子癇前期胎盤組織中全基因組lncRNAs表達模式。
江西省婦幼保健院劉淮教授長期從事高危妊娠,難產,婦科腫瘤,婦科炎癥,婦科內分泌的診治和基礎研究。帶領研究小組首次利用Arraystar Human LncRNA芯片研究子癇前期胎盤組織中全基因組lncRNAs表達模式。發現大量lncRNAs在子癇前期胎盤異常表達,并挑選3個lncRNA:LOC391533,LOC284100和CEACAMP8進行了深入數據分析和研究,表明lncRNAs可能在子癇前期發育中起到關鍵的作用。為先兆子癇的生物機制深入研究提供新的見解,并為今后治療先兆子癇提供潛在靶標。該研究成果刊登在國際期刊Plos One(影響因子3.534)。(芯片實驗由康成提供技術服務)
研究背景:
先兆子癇是導致全球圍產兒發病和死亡的主要因素。先兆子癇影響3-5%的孕婦,可能導致每年全球60,000例產婦死亡。到目前為止,治療的唯一方法是引產。由于在葡萄胎妊娠患者中可以觀察到先兆子癇,而胎兒實際并不存在,表明胎盤異常足以導致先兆子癇。長鏈非編碼RNA(lncRNAs)是一類重要的調控RNA,參與多種生物學功能調控,在許多疾病中有異常表達。LncRNA是近5年來生物和醫學界的熱門研究領域,但是lncRNA在先兆子癇中的作用目前仍不清楚。本次研究目的是利用Arraystar Human LncRNA 芯片對lncRNA在先兆子癇胎盤中的lncRNA表達和功能展開系統研究。
研究思路:
為了系統的研究lncRNA在先兆子癇中的作用,研究者采用美國Arraystar Human LncRNA芯片,對6例子癇前期胎盤和5例正常妊娠胎盤的lncRNA表達進行分析。與正常胎盤相比,子癇前期胎盤中738個lncRNA表達有明顯差異,差異倍數達到1.5倍以上。
借助于生物信息分析,基于差異表達lncRNAs和mRNAs的相關性,研究者構建了編碼-非編碼基因共表達網絡(CNC網絡)。結合對差異表達lncRNAs和mRNAs的CNC網絡和針對基因的GO分析,挑選得到3個lncRNA進一步研究lncRNA與子癇前期的關系。這3個lncRNA是LOC391533, LOC284100和 CEACAMP8。
研究者采用qPCR方法,在40例子癇前期胎盤和40對照樣本中檢測這三個lncRNA的表達。結果顯示,與正常對照相比,這3個lncRNA在子癇前期胎盤中存在異常表達。
技術路線:
結果展示: 

A. 芯片篩選得到的差異表達的lncRNA,上調(左),下調(右)
B. 編碼基因和非編碼基因共表達網絡圖(CNC network)
研究意義:
本研究是第一次利用Arraystar Human LncRNA芯片研究子癇前期胎盤組織中全基因組lncRNAs表達模式。結果揭示,與正常組相比,lncRNAs在子癇前期胎盤異常表達,表明lncRNAs可能在子癇前期發育中起到關鍵的作用。LOC391533,LOC284100和CEACAMP8失調可能參與了先兆子癇機制。本研究為治療先兆子癇提供了潛在的lncRNA靶標以及對先兆子癇生物學機制的深入研究提供新的見解。
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原文出處:
LncRNAs Expression in Preeclampsia Placenta Reveals the Potential Role of LncRNAs Contributing to Preeclampsia Pathogenesis. PLoS ONE 8(11): e81437.
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