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CRISPR新品巡禮:Sigma-Aldrich[新品推薦]
【字體: 大 中 小 】 時間:2014年07月24日 來源:生物通
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在基因組編輯方面,Sigma-Aldrich向來是個先鋒。早在近十年前,它就推出了基因組編輯工具鋅指核酸酶(ZFN),而在去年8月,它又率先推出了CRISPR/Cas研究工具——Sigma CRISPRs。因此論這一方面的經(jīng)驗,沒人比Sigma-Aldrich更豐富。而這種經(jīng)驗在設計基因組編輯工具時尤為重要。
在基因組編輯方面,Sigma-Aldrich向來是個先鋒。早在近十年前,它就推出了基因組編輯工具鋅指核酸酶(ZFN),而在去年8月,它又率先推出了CRISPR/Cas研究工具——Sigma CRISPRs。因此論這一方面的經(jīng)驗,沒人比Sigma-Aldrich更豐富。而這種經(jīng)驗在設計基因組編輯工具時尤為重要。Sigma CRISPRs上線一年來,產(chǎn)品線也在不斷豐富,下面就讓我們來看看具體有哪些產(chǎn)品。
All-in-one的表達質(zhì)粒
這個All-in-one的載體能同時表達Cas9蛋白和gRNA,而不需要使用兩個載體分別表達。在這個載體上,人U6啟動子驅(qū)動gRNA表達,而CMV啟動子被用于表達Cas9和熒光蛋白(GFP或RFP)。他們之所以選擇人U6啟動子,是因為它優(yōu)于H1啟動子,確保了gRNA的表達效率。GFP或RFP通過2A肽段與Cas9的C端融合,實現(xiàn)了轉(zhuǎn)染效率的追蹤,也能通過FACS富集目標細胞群。
對于人類、小鼠和大鼠基因組的編碼區(qū),Sigma提供預設計的CRISPR載體,可最大限度降低脫靶效應。對于其他的區(qū)域或物種,Sigma也提供定制設計服務,具體請咨詢。
高保真的CRISPR切口酶
今年5月,Sigma還推出了CRISPR配對切口酶(nickase)。這種高保真的CRISPR技術經(jīng)過設計,可減少意外的脫靶基因修飾。傳統(tǒng)的CRISPR會導致DNA雙鏈斷裂,但它們也容易產(chǎn)生脫靶的基因修飾。與此相反,一對高保真的CRISPR切口酶分別在相對的兩條DNA鏈上產(chǎn)生切口,從而形成雙鏈斷裂。這種設計能明顯減少脫靶的可能性,同時保持高效而又特異的基因修飾。對于干細胞研究和基因治療等比較關心脫靶效應的應用,CRISPR切口酶可能更加理想。

在訂購CRISPR切口酶時,我們會得到兩個立即可轉(zhuǎn)染的質(zhì)粒,這些質(zhì)粒表達gRNA,但必須注意,它們不同于上面的all-in-one載體,不表達核酸酶。Cas9-D10A切口酶必須單獨訂購。Sigma也同樣提供預設計和定制設計的質(zhì)粒。
純的gRNA以及陽性和陰性對照
此外,Sigma還以純RNA的形式提供即用的gRNA,適用于顯微注射或細胞培養(yǎng)。對于那些想建立轉(zhuǎn)基因動物模型或擔心質(zhì)粒整合的研究人員而言,這種CRISPR RNA形式很理想。不過,這只是單獨的gRNA,Cas9核酸酶必須單獨購買。
陽性對照是在人EMX1基因上驗證過的,可提供參照,讓研究人員對其基因組編輯實驗的效率進行平行的評估。目前Sigma提供即用的EMX1 positive controls for both single gRNAs(傳統(tǒng)CRISPR)和CRISPR paired nickases(高保真CRISPR)。
CRISPR通用型陰性對照則是all-in-one的轉(zhuǎn)染級別質(zhì)粒,表達野生型Cas9核酸酶,以及gRNA序列,不靶定已知的人類、小鼠或大鼠基因。(生物通 余亮)