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新型移動HIV-DNA檢測技術(shù)
【字體: 大 中 小 】 時間:2014年06月10日 來源:生物通
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最近,在國際知名雜志《Analytical Chemistry》發(fā)表的一項研究中,美國萊斯大學(xué)的生物工程師們研發(fā)出一種簡單、高度精確的檢測技術(shù),來檢測患者體內(nèi)的HIV跡象及病情發(fā)展情況。
生物通報道:最近,在國際知名雜志《Analytical Chemistry》發(fā)表的一項研究中,美國萊斯大學(xué)的生物工程師們研發(fā)出一種簡單、高度精確的檢測技術(shù),來檢測患者體內(nèi)的HIV跡象及病情發(fā)展情況。
萊斯大學(xué)生物工程師、全球衛(wèi)生技術(shù)學(xué)院的主任Rebecca Richards-Kortum稱,當(dāng)前診斷嬰兒HIV和監(jiān)測病毒載量的金標(biāo)準(zhǔn),通常是依賴僅在診所可用的實驗室設(shè)備和專業(yè)技術(shù)。這項研究,開發(fā)出以核酸為基礎(chǔ)的新型HIV檢測技術(shù),能夠在醫(yī)療保健單位進(jìn)行檢測。
本文共同第一作者是Richards-Kortum 實驗室的研究生Zachary Crannell和Brittany Rohrman,他們開展了這項概念驗證性工作,在今年早些時候,他們利用類似的技術(shù)檢測到引起腹瀉病隱孢子蟲病的寄生蟲。
這項新型檢測技術(shù),用基于重組酶聚合酶擴增(RPA)技術(shù)取代了基于聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)的復(fù)雜實驗室程序,RPA可以對血液中的遺傳標(biāo)記物進(jìn)行快速多重擴增,從而使病毒的遺傳標(biāo)記物很容易地檢測到。在一個被稱為qRPA的檢測中,利用可通過輕便機器進(jìn)行定量檢測的熒光探針,靶定和標(biāo)記HIV DNA中的一段特定序列。最后,通過熒光DNA的軟件分析,就可使得臨床醫(yī)生以極高的準(zhǔn)確性,來確定病毒是否存在于患者的血液內(nèi),或病毒的量是多少。
研究人員通過放大內(nèi)部陽性對照對測試進(jìn)行校準(zhǔn)。Rohrman稱:“利用跟HIV序列相同的引物擴增,因此檢測試驗可以正常進(jìn)行。”研究人員最初只是打算尋找嬰兒中的HIV,但是該技術(shù)還可以幫助他們追蹤老年患者機體中的病毒載量。Crannell稱:“臨床醫(yī)生能夠?qū)崟r監(jiān)測患者體內(nèi)的病毒載量,從而確保患者是否對治療發(fā)生反應(yīng),這非常的重要。”
研究人員稱,為了臨床可行性,一種HIV DNA檢測能夠定量的病毒載量,必須超過四個數(shù)量級,從很高到很低。他們稱,這種新型試驗很容易滿足這個目標(biāo)。
他們正在開發(fā)用于資源匱乏地區(qū)的工具,在這些地區(qū)高科技實驗室設(shè)備無法使用。盡管研究人員使用熱循環(huán)儀來進(jìn)行檢測,但他們正在研究一種技術(shù),使得整個操作步驟維持在室溫和體溫之間,從而確保實驗的通用性和準(zhǔn)確性。
(生物通:王英)
延伸閱讀:華人學(xué)者《德國應(yīng)用化學(xué)》:新的HIV疫苗研制方法
生物通推薦原文摘要:
Quantification of HIV-1 DNA Using Real-Time Recombinase Polymerase Amplification
Abstract: Although recombinase polymerase amplification (RPA) has many advantages for the detection of pathogenic nucleic acids in point-of-care applications, RPA has not yet been implemented to quantify sample concentration using a standard curve. Here, we describe a real-time RPA assay with an internal positive control and an algorithm that analyzes real-time fluorescence data to quantify HIV-1 DNA. We show that DNA concentration and the onset of detectable amplification are correlated by an exponential standard curve. In a set of experiments in which the standard curve and algorithm were used to analyze and quantify additional DNA samples, the algorithm predicted an average concentration within 1 order of magnitude of the correct concentration for all HIV-1 DNA concentrations tested. These results suggest that quantitative RPA (qRPA) may serve as a powerful tool for quantifying nucleic acids and may be adapted for use in single-sample point-of-care diagnostic systems.
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