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替代PCR,RPA在癌癥研究中的應(yīng)用
【字體: 大 中 小 】 時間:2014年11月03日 來源:生物通
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新加坡A*STAR的研究團(tuán)隊(duì)去年六月在Lab on a Chip雜志上,發(fā)表了一種能夠快速檢測癌癥單點(diǎn)突變的新技術(shù),等溫固相擴(kuò)增/檢測(ISAD)。這是一種無需標(biāo)記的實(shí)時檢測技術(shù),將基于硅基微環(huán)(silicon microring)的固相擴(kuò)增與等溫重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)結(jié)合在一起。
生物通報道:重組酶聚合酶擴(kuò)增RPA被稱為是可以替代PCR的核酸檢測技術(shù)。RPA擴(kuò)增的速度非常快,靈敏度高,對硬件設(shè)備要求低,而且不需要復(fù)雜的樣本處理。這樣的技術(shù)特別適合于體外診斷、獸醫(yī)、食品安全、生物防御、農(nóng)業(yè)等領(lǐng)域。
自人類對癌癥“宣戰(zhàn)”以來已經(jīng)過去了四十多年,這種惡性疾病仍舊是一團(tuán)揮之不去的陰影。統(tǒng)計數(shù)據(jù)表明,2012年世界上有15%的死亡是癌癥造成的。隨著發(fā)展中國家逐漸接納西方國家的飲食和生活方式,這一數(shù)字在未來幾十年中肯定還會上升,這無疑給發(fā)展中國家敲響了警鐘。
RPA用于癌癥突變檢測
新加坡A*STAR的研究團(tuán)隊(duì)去年六月在Lab on a Chip雜志上,發(fā)表了一種能夠快速檢測癌癥單點(diǎn)突變的新技術(shù),等溫固相擴(kuò)增/檢測(ISAD)。這是一種無需標(biāo)記的實(shí)時檢測技術(shù),將基于硅基微環(huán)(silicon microring)的固相擴(kuò)增與等溫重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)結(jié)合在一起。
在這項(xiàng)研究中,ISAD主要用于檢測HRAS(Harvey RAS)基因的單點(diǎn)突變。在固相擴(kuò)增階段,引物直接連在設(shè)備的表面。在擴(kuò)增過程中,硅基微環(huán)諧振器會發(fā)生光的波長漂移,在此基礎(chǔ)上就能對擴(kuò)增DNA進(jìn)行檢測,不需要任何標(biāo)記。(延伸閱讀:核酸檢測的一場革命,可替代PCR的犀利技術(shù))
研究顯示,與RPA和傳統(tǒng)PCR方法相比,ISAD技術(shù)的靈敏度要高一百倍。這個技術(shù)能夠在擴(kuò)增過程中區(qū)分HRAS基因的一個單點(diǎn)突變。由此可見,ISAD能夠用于突變、單核苷段多態(tài)性和癌癥指標(biāo)的檢測。(參考文獻(xiàn):Real-time, label-free isothermal solid-phase amplification/detection (ISAD) device for rapid detection of genetic alteration in cancers.)
RPA用于抗癌藥物篩選
去年十月,Talanta雜志上也發(fā)表了一項(xiàng)用到RPA技術(shù)的癌癥研究。該研究在超靈敏生物條碼分析(BBC)、適配體(aptamer)和RPA的基礎(chǔ)上,開發(fā)了一個檢測細(xì)胞色素C(Cyto-c)的新生物條碼分析法(ABC)。細(xì)胞色素C是細(xì)胞死亡的重要標(biāo)志物。
適配體是一種單鏈短DNA,它折疊形成的3D結(jié)構(gòu)能夠結(jié)合特定的目標(biāo)分子,具有高親和力和特異性。
研究人員在BBC分析的基礎(chǔ)上進(jìn)行優(yōu)化,采用了Cyto-c特異性的適配子,并用等溫重組酶聚合酶擴(kuò)增(RPA)替代了耗時長的PCR。研究顯示,ABC分析的檢出限低至10 ng/mL,而且可以在三小時內(nèi)完成。研究人員用ABC方法對一些潛在的抗癌藥物進(jìn)行了體外測試,檢驗(yàn)了它們對不耐藥和多重耐藥性肝癌的殺傷效果。(參考文獻(xiàn):An aptamer-based bio-barcode assay with isothermal recombinase polymerase amplification for cytochrome-c detection and anti-cancer drug screening.)
生物通編輯:葉予