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金秋十月,重磅來襲,PacBio第三代測序儀讀長再度升級
【字體: 大 中 小 】 時間:2014年10月21日 來源:
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目前市面上**的第三代測序設備供應商Pacific Biosciences于2014年10月下旬再度升級了測序聚合酶和化學染料(P6-C4),PacBio的新試劑旨在進一步增加其原本就傲視群雄的序列讀取長度,這無疑是測序屆爆發的又一磅重彈,長讀長對于測序后序列拼裝的巨大意義大家都十分清楚了。下面讓我們來看看新試劑的表現如何。
目前市面上**的第三代測序設備供應商Pacific Biosciences于2014年10月下旬再度升級了測序聚合酶和化學染料(P6-C4),PacBio的新試劑旨在進一步增加其原本就傲視群雄的序列讀取長度,這無疑是測序屆爆發的又一磅重彈,長讀長對于測序后序列拼裝的巨大意義大家都十分清楚了。下面讓我們來看看新試劑的表現如何:
P6-C4試劑可以將PacBio的平均讀取長度提高到10000bp或者更長,有>50%的序列長度都超過了14000bp,*長讀長> 40000bp,在業界遙遙領先。并且,在通量上也有了進一步提高,升級后每個SMRT Cell的有效數據產出量可以大于550M。這種性能的提高,其中一部分原因是PacBio在原有C3試劑的光保護染料(photo-protected dyes of the C3 chemistry)基礎上進行了升級,新的化學試劑同時結合了C2的精確度與C3的讀取長度兩種優點。PacBio建議用戶采用新的化學試劑來實現所有基于PacBio測序儀的相關應用。

本次升級同時發布的還有新的軟件SMRT® Analysis v2.3。軟件包括改進的長擴增子分析,Iso-Seq™應用,Quiver以及CCS,同時還有性能的提升。這些更新進一步增強了結果的準確度,加快了分析速度,并且為混合的各種大小的擴增子分析如全長HLA Class I 和Class II 基因提供了更多的選擇。