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Sigma推出基因組編輯工具CRISPR[新品推薦]
【字體: 大 中 小 】 時間:2013年08月30日 來源:生物通
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Sigma-Aldrich公司近日宣布推出Sigma CRISPRs,一款經濟的哺乳動物基因組編輯工具,適合篩選和探索性研究。這是繼鋅指核酸酶(ZFN)以來,Sigma推出的第二款基因組編輯工具。
生物通報道 Sigma-Aldrich公司近日宣布推出Sigma CRISPRs,一款經濟的哺乳動物基因組編輯工具,適合篩選和探索性研究。這是繼鋅指核酸酶(ZFN)以來,Sigma推出的第二款基因組編輯工具。
CRISPR指的是規律成簇的間隔短回文重復(Clustered regularly interspaced short palindromic repeats)。CRISPR/Cas是在大多數細菌和古細菌中發現的一種天然免疫系統,可用來對抗入侵的病毒及外源DNA。Sigma CRISPRs利用可定制的RNA-核酸酶復合物來實現哺乳動物基因組特定位點的編輯。
在細菌中,來自入侵病毒的短DNA序列(間隔區)被摻入CRISPR位點,充當之前感染的“記憶”。再次感染引發互補的成熟CRISPR RNA(crRNA)找到匹配的序列,為CRISPR相關(Cas)核酸酶在特定DNA序列切割雙鏈提供了特異性。

Cas9是由crRNA和tracrRNA(反式激活crRNA)引導、切割特定DNA序列的核酸酶。引導RNA(gRNA)可設計成包含發夾結構,以模擬tracrRNA-crRNA復合物。結合特異性是根據gRNA和三核苷酸NGG序列(protospacer adjacent motif,PAM)。對于位點特異的編輯,CRISPR/Cas9系統至少需要Cas9核酸酶和gRNA。
Sigma CRISPRs以單個質粒載體提供,其中包含GFP,可快速富集編輯過的細胞。當然,您也可以利用專門的生物信息學工具在線定制(www.sigma.com/crisprs)。

Sigma獨有的在線設計工具讓用戶可根據CRISPR/Cas靶定的要求,識別人、小鼠和大鼠外顯子中的最佳靶位點。它能夠自動應用CRISPR/Cas最佳設計實踐,包括靶位點與基因組中其他位點至少要求3個堿基對不匹配,從而最大限度減少了脫靶效應。
“Sigma在2008年開發出CompoZr ZFN技術,如今ZFN已成為基因組編輯的金標準。我們利用這一專長創造出Sigma CRISPRs,它讓研究人員以更快、更經濟的方式篩選目的基因。在利用Sigma CRISPRs 鑒定出重要靶點之后,可通過超特異的CompoZr ZFNs 來驗證生物學上相關的突變,以減少潛在的脫靶,”Sigma Life Science功能基因組學市場部經理Shawn Shafer博士談道。
Sigma-Aldrich研發部門的首席研究員Greg Davis博士認為:“操控哺乳動物基因組的能力對生物學而言是革命性的。Sigma CRISPR/Cas技術作為一款早期、經濟的基因編輯工具,為開發和使用帶來巨大希望。”(生物通 余亮)