生物通報(bào)道  來自中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院、中山大學(xué)癌癥中心、南京醫(yī)科大學(xué)等機(jī)構(gòu)的研究人員，通過全基因組關(guān)聯(lián)研究確定了一個與食管鱗狀細(xì)胞癌（esophageal squamous-cell carcinoma，ESCC）生存期相關(guān)的基因SLC39A6。相關(guān)研究論文于5月5日在線發(fā)表在國際頂級專業(yè)期刊《自然遺傳學(xué)》（Nature Genetics）雜志上。

來自中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院的林東昕（Dongxin Lin）教授為這篇文章的通訊作者。其主要從事系統(tǒng)研究致癌物代謝、DNA修復(fù)、細(xì)胞周期和凋亡控制、腫瘤免疫等系統(tǒng)的基因遺傳變異與肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、結(jié)-直腸癌等常見腫瘤發(fā)生和發(fā)展的關(guān)系，在癌癥研究領(lǐng)域作出了重要的貢獻(xiàn)。至今已發(fā)表研究論文近200篇，其中發(fā)表在Nat Genet，J.　Exp.　Med.等著名或重要的國際專業(yè)期刊的論文100余篇，累計(jì)SCI影響因子600余分，論文被引用3000多次。

食管癌是人類常見的惡性腫瘤之一，其發(fā)病率具有明顯的區(qū)域性，其中70%在我國。，食管癌從組織病理學(xué)類型可分為鱗狀細(xì)胞癌和腺癌。在中國的食管癌主要是鱗狀細(xì)胞癌（簡稱鱗癌，ESCC），約占95%。因早期無明顯特異的臨床癥狀，大多數(shù)患者發(fā)現(xiàn)確診已到中晚期，5年生存率只有10%左右，但早期食管癌患者5年生存率可達(dá)90%以上。通過研究揭示與食管癌相關(guān)的個人遺傳因素，尋找早期檢測和診斷的生物標(biāo)記，對于疾病及早診斷以及靶向性治療無疑具有重要的意義。

在這篇文章中，研究人員利用全基因組關(guān)聯(lián)研究（GWAS）方法，研究了食管鱗狀細(xì)胞癌患者生存預(yù)后相關(guān)的遺傳因素。他們首先對1331個食管鱗狀細(xì)胞癌患者的基因組DNA進(jìn)行了全基因組分析，然后對發(fā)現(xiàn)的相關(guān)SNPs在兩個獨(dú)立樣本共1962名食管鱗狀細(xì)胞癌患者中進(jìn)行了驗(yàn)證。確定了SLC39A6的rs1050631與受累個體的生存時間相關(guān)，綜合樣本的食管鱗狀細(xì)胞癌的死亡危險(xiǎn)比率為1.30。

研究人員證實(shí)，定位在SLC39A6 5′ UTR區(qū)域內(nèi)的rs7242481，因破壞了SLC39A6 5′ UTR與轉(zhuǎn)錄抑制因子結(jié)合而導(dǎo)致SLC39A6高表達(dá)。采用免疫組化染色食管鱗狀細(xì)胞癌組織，研究人員證實(shí)SLC39A6高表達(dá)與晚期食管鱗狀細(xì)胞癌患者生存期縮短有關(guān)。而下調(diào)SLC39A6表達(dá)，則可抑制食管鱗狀細(xì)胞癌細(xì)胞的增殖與侵襲力。

新研究鑒定出了與食管鱗狀細(xì)胞癌預(yù)后相關(guān)的新遺傳區(qū)域，這些研究推動了對食管鱗狀細(xì)胞癌發(fā)生發(fā)展機(jī)制的認(rèn)識，同時也為食管鱗狀細(xì)胞癌提供了一個潛在的治療靶點(diǎn)。

（生物通：何嬙）

生物通推薦原文摘要：

Genome-wide association study identifies common variants in SLC39A6 associated with length of survival in esophageal squamous-cell carcinoma

We conducted a genome-wide scan of SNPs to identify variants associated with length of survival in 1,331 individuals with esophageal squamous-cell carcinoma (ESCC), with associations validated in 2 independent sets including 1,962 individuals with this cancer. We identified rs1050631 in SLC39A6 as associated with the survival times of affected individuals, with the hazard ratio for death from ESCC in the combined sample being 1.30 (95% confidence interval (CI) = 1.19−1.43; P = 3.77 × 10−8). rs7242481, located in the 5′ UTR of SLC39A6, disturbs a transcriptional repressor binding site and results in upregulation of SLC39A6 expression. Immunohistochemical staining of ESCC tissues showed that higher expression of SLC39A6 protein was correlated with shorter length of survival in individuals with advanced ESCC (P = 0.013). Knockdown of SLC39A6 expression suppressed proliferation and invasion in ESCC cells. These results suggest that SLC39A6 has an important role in the prognosis of ESCC and may be a potential therapeutic target.

作者簡介：

林東昕

教授、博士生導(dǎo)師。現(xiàn)任中國醫(yī)學(xué)科學(xué)院中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院腫瘤研究所病因及癌變研究室主任，癌發(fā)生及預(yù)防分子機(jī)理北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室主任；中國協(xié)和醫(yī)科大學(xué)學(xué)術(shù)委員會委員，北京大學(xué)醫(yī)學(xué)部學(xué)術(shù)委員會委員，分子腫瘤學(xué)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室學(xué)術(shù)委員。國家杰出青年科學(xué)基金獲得者；衛(wèi)生部有突出貢獻(xiàn)中青年專家；國務(wù)院頒發(fā)政府特殊津貼專家。

研究領(lǐng)域：常見腫瘤發(fā)生發(fā)展及其遺傳易感性的分子機(jī)制；腫瘤分子流行病學(xué)；個體化醫(yī)學(xué)。承擔(dān)國家“973”重大基礎(chǔ)研究規(guī)劃項(xiàng)目、國家“863”高技術(shù)項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金重大項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金重點(diǎn)項(xiàng)目、國家杰出青年科學(xué)基金項(xiàng)目、國家醫(yī)學(xué)科技攻關(guān)項(xiàng)目、國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目、北京市科委重大項(xiàng)目、教育部跨世紀(jì)優(yōu)秀人才基金項(xiàng)目和海外青年學(xué)者合作研究項(xiàng)目等。
　　
主要學(xué)術(shù)貢獻(xiàn)：較系統(tǒng)地研究了遺傳變異與常見腫瘤發(fā)生和發(fā)展的關(guān)系。至今已發(fā)表研究論文近200篇，其中發(fā)表在Nat Genet，J.　Exp.　Med.，J.　Natl.　Cancer　Inst.，Gastroenterology，Cancer　Res.，Clin.　Cancer　Res.，Oncogene，Hum.　Mutat.，Pharmacogenet　Genomics，Int.　J.　Cancer　等著名或重要的國際專業(yè)期刊的論文100余篇，累計(jì)SCI影響因子600余分，論文被引用3000多次。主編《腫瘤遺傳學(xué)》、《腫瘤學(xué)》、《臨床腫瘤學(xué)》和《肺癌診斷治療學(xué)》專著4部。研究成果獲2002年中華醫(yī)學(xué)科技獎三等獎、2003年北京市科學(xué)技術(shù)獎二等獎、2005年中華醫(yī)學(xué)科技獎二等獎和北京市科學(xué)技術(shù)獎一等獎、2006年國家自然科學(xué)獎二等獎、2008年國家科技進(jìn)步獎二等獎。