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中國醫學科學院Nature子刊癌癥研究新發現
【字體: 大 中 小 】 時間:2013年05月07日 來源:生物通
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來自中國醫學科學院北京協和醫學院、中山大學癌癥中心、南京醫科大學等機構的研究人員,通過全基因組關聯研究確定了一個與食管鱗狀細胞癌(esophageal squamous-cell carcinoma,ESCC)生存期相關的基因SLC39A6。相關研究論文于5月5日在線發表在國際頂級專業期刊《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。
生物通報道 來自中國醫學科學院北京協和醫學院、中山大學癌癥中心、南京醫科大學等機構的研究人員,通過全基因組關聯研究確定了一個與食管鱗狀細胞癌(esophageal squamous-cell carcinoma,ESCC)生存期相關的基因SLC39A6。相關研究論文于5月5日在線發表在國際頂級專業期刊《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。
來自中國醫學科學院北京協和醫學院的林東昕(Dongxin Lin)教授為這篇文章的通訊作者。其主要從事系統研究致癌物代謝、DNA修復、細胞周期和凋亡控制、腫瘤免疫等系統的基因遺傳變異與肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、結-直腸癌等常見腫瘤發生和發展的關系,在癌癥研究領域作出了重要的貢獻。至今已發表研究論文近200篇,其中發表在Nat Genet,J. Exp. Med.等著名或重要的國際專業期刊的論文100余篇,累計SCI影響因子600余分,論文被引用3000多次。
食管癌是人類常見的惡性腫瘤之一,其發病率具有明顯的區域性,其中70%在我國。,食管癌從組織病理學類型可分為鱗狀細胞癌和腺癌。在中國的食管癌主要是鱗狀細胞癌(簡稱鱗癌,ESCC),約占95%。因早期無明顯特異的臨床癥狀,大多數患者發現確診已到中晚期,5年生存率只有10%左右,但早期食管癌患者5年生存率可達90%以上。通過研究揭示與食管癌相關的個人遺傳因素,尋找早期檢測和診斷的生物標記,對于疾病及早診斷以及靶向性治療無疑具有重要的意義。
在這篇文章中,研究人員利用全基因組關聯研究(GWAS)方法,研究了食管鱗狀細胞癌患者生存預后相關的遺傳因素。他們首先對1331個食管鱗狀細胞癌患者的基因組DNA進行了全基因組分析,然后對發現的相關SNPs在兩個獨立樣本共1962名食管鱗狀細胞癌患者中進行了驗證。確定了SLC39A6的rs1050631與受累個體的生存時間相關,綜合樣本的食管鱗狀細胞癌的死亡危險比率為1.30。
研究人員證實,定位在SLC39A6 5′ UTR區域內的rs7242481,因破壞了SLC39A6 5′ UTR與轉錄抑制因子結合而導致SLC39A6高表達。采用免疫組化染色食管鱗狀細胞癌組織,研究人員證實SLC39A6高表達與晚期食管鱗狀細胞癌患者生存期縮短有關。而下調SLC39A6表達,則可抑制食管鱗狀細胞癌細胞的增殖與侵襲力。
新研究鑒定出了與食管鱗狀細胞癌預后相關的新遺傳區域,這些研究推動了對食管鱗狀細胞癌發生發展機制的認識,同時也為食管鱗狀細胞癌提供了一個潛在的治療靶點。
(生物通:何嬙)
生物通推薦原文摘要:
Genome-wide association study identifies common variants in SLC39A6 associated with length of survival in esophageal squamous-cell carcinoma
We conducted a genome-wide scan of SNPs to identify variants associated with length of survival in 1,331 individuals with esophageal squamous-cell carcinoma (ESCC), with associations validated in 2 independent sets including 1,962 individuals with this cancer. We identified rs1050631 in SLC39A6 as associated with the survival times of affected individuals, with the hazard ratio for death from ESCC in the combined sample being 1.30 (95% confidence interval (CI) = 1.19−1.43; P = 3.77 × 10−8). rs7242481, located in the 5′ UTR of SLC39A6, disturbs a transcriptional repressor binding site and results in upregulation of SLC39A6 expression. Immunohistochemical staining of ESCC tissues showed that higher expression of SLC39A6 protein was correlated with shorter length of survival in individuals with advanced ESCC (P = 0.013). Knockdown of SLC39A6 expression suppressed proliferation and invasion in ESCC cells. These results suggest that SLC39A6 has an important role in the prognosis of ESCC and may be a potential therapeutic target.
作者簡介:
林東昕
教授、博士生導師。現任中國醫學科學院中國協和醫科大學腫瘤醫院腫瘤研究所病因及癌變研究室主任,癌發生及預防分子機理北京市重點實驗室主任;中國協和醫科大學學術委員會委員,北京大學醫學部學術委員會委員,分子腫瘤學國家重點實驗室學術委員。國家杰出青年科學基金獲得者;衛生部有突出貢獻中青年專家;國務院頒發政府特殊津貼專家。
研究領域:常見腫瘤發生發展及其遺傳易感性的分子機制;腫瘤分子流行病學;個體化醫學。承擔國家“973”重大基礎研究規劃項目、國家“863”高技術項目、國家自然科學基金重大項目、國家自然科學基金重點項目、國家杰出青年科學基金項目、國家醫學科技攻關項目、國家自然科學基金項目、北京市科委重大項目、教育部跨世紀優秀人才基金項目和海外青年學者合作研究項目等。
主要學術貢獻:較系統地研究了遺傳變異與常見腫瘤發生和發展的關系。至今已發表研究論文近200篇,其中發表在Nat Genet,J. Exp. Med.,J. Natl. Cancer Inst.,Gastroenterology,Cancer Res.,Clin. Cancer Res.,Oncogene,Hum. Mutat.,Pharmacogenet Genomics,Int. J. Cancer 等著名或重要的國際專業期刊的論文100余篇,累計SCI影響因子600余分,論文被引用3000多次。主編《腫瘤遺傳學》、《腫瘤學》、《臨床腫瘤學》和《肺癌診斷治療學》專著4部。研究成果獲2002年中華醫學科技獎三等獎、2003年北京市科學技術獎二等獎、2005年中華醫學科技獎二等獎和北京市科學技術獎一等獎、2006年國家自然科學獎二等獎、2008年國家科技進步獎二等獎。