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        中國醫學科學院Nature Genetics揭示食管癌易感基因

        【字體: 時間:2012年09月11日 來源:生物通

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          近日來自中國醫學科學院腫瘤研究所、哈佛大學公共衛生學院等10多家機構的研究人員通過全基因組關聯分析鑒別了多個全新的中國人群食管鱗狀細胞癌易感位點,并分析了基因與環境之間的相互作用,相關研究論文于9月9日在線發表在國際頂級專業期刊《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。

          

        生物通報道 近日來自中國醫學科學院腫瘤研究所、哈佛大學公共衛生學院等10多家機構的研究人員通過全基因組關聯分析鑒別了多個全新的中國人群食管鱗狀細胞癌(Esophageal squamous cell carcinoma)易感位點,并分析了基因與環境之間的相互作用,相關研究論文于9月9日在線發表在國際頂級專業期刊《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。

        中國醫學科學院腫瘤研究所腫瘤醫院的林東昕教授是這篇文章的通訊作者。他曾系統地研究了致癌物代謝、DNA修復、細胞周期和凋亡控制、腫瘤免疫等系統的基因遺傳變異與肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、結-直腸癌等常見腫瘤發生和發展的關系,在癌癥研究領域作出了重要的貢獻。2006年至今已發表研究論文100多篇,其中發表在Nat Genet, J. Exp. Med等著名或重要的國際專業期刊論文70多篇,論文被引用900多次。

        作為世界上最常見的六大惡性腫瘤病之一,食管癌因早期無明顯特異的臨床癥狀,大多數患者發現確診已到中晚期,5年生存率只有10%左右,但早期食管癌患者5年生存率可達90%以上。食管癌從組織病理學類型可分為鱗狀細胞癌和腺癌。在中國的食管癌主要是鱗狀細胞癌,約占95%。對食管癌的病因國內外以往都有許多研究,結論雖然不完全一致,但吸煙和重度飲酒是很明確的食管癌危險因素。此外還有研究報道暴露于特定化學致癌物、某些營養素缺乏也與食管癌有關。盡管環境因素和生活方式被認為是食管癌乃至其他一些消化道腫瘤的病因因素,但同樣有這些因素的人群中只有少量個體發病。這表明食管癌的發生還跟患者自身的遺傳因素有很大關系,可能是環境與遺傳共同作用的結果。因此通過研究來揭示導致食管癌發生的個人遺傳因素,對尋找早期檢測和診斷的生物標記以及治療的潛在靶點無疑具有重要的意義。

        在這篇文章中,為了闡明食管鱗狀細胞癌發生發展的遺傳病因,研究人員對2,031例食管鱗狀細胞癌患者和2,044個正常對照組進行了全基因組遺傳變異的關聯研究,并分析了全基因組基因與環境的相互作用。進而在獨立的一組8,092個食管鱗狀細胞癌患者和8,620個正常對照中進行了驗證,確定了9個新的食管鱗狀細胞癌易感位點,其中七個分別定位在4q23、16q12.1、17q21、22q12、3q27、17p13 和18p11染色體區域,具有顯著的邊際效應;另外兩個定位在2q22 和13q33染色體區域,只在基因與飲酒相互作用中具有顯著相關性。4q23位點內的變異,包括ADH基因簇,每一個與食管鱗狀細胞癌風險具有相關性的均與飲酒有顯著的相互作用。研究人員還證實了12q24上ALDH2位點與食管鱗狀細胞癌的相關性,且聯合分析顯示具有ADH1B和ALDH2風險等位基因的飲酒者相比于沒有這些等位基因的飲酒者食管鱗狀細胞癌風險增加了4倍。

        新研究闡明了食管鱗狀細胞癌風險的直接遺傳貢獻因子,以及通過與飲酒的相互作用促成食管鱗狀細胞癌的遺傳因子。這些這些研究結果推進了對食管鱗狀細胞癌發生發展機制的認識,同時也為食管鱗狀細胞癌的預防和治療提供了潛在的靶點。

        (生物通:何嬙)

        生物通推薦原文摘要:

        Genome-wide association analyses of esophageal squamous cell carcinoma in Chinese identify multiple susceptibility loci and gene-environment interactions

        We conducted a genome-wide association study (GWAS) and a genome-wide gene-environment interaction analysis of esophageal squamous-cell carcinoma (ESCC) in 2,031 affected individuals (cases) and 2,044 controls with independent validation in 8,092 cases and 8,620 controls. We identified nine new ESCC susceptibility loci, of which seven, at chromosomes 4q23, 16q12.1, 17q21, 22q12, 3q27, 17p13 and 18p11, had a significant marginal effect (P = 1.78 × 10−39 to P = 2.49 × 10−11) and two of which, at 2q22 and 13q33, had a significant association only in the gene–alcohol drinking interaction (gene-environment interaction P (PG × E) = 4.39 × 10−11 and PG × E = 4.80 × 10−8, respectively). Variants at the 4q23 locus, which includes the ADH cluster, each had a significant interaction with alcohol drinking in their association with ESCC risk (PG × E = 2.54 × 10−7 to PG × E = 3.23 × 10−2). We confirmed the known association of the ALDH2 locus on 12q24 to ESCC, and a joint analysis showed that drinkers with both of the ADH1B and ALDH2 risk alleles had a fourfold increased risk for ESCC compared to drinkers without these risk alleles. Our results underscore the direct genetic contribution to ESCC risk, as well as the genetic contribution to ESCC through interaction with alcohol consumption.

        作者簡介:

        林東昕

        研究員(教授)、博士生導師。現任中國醫學科學院北京協和醫學院腫瘤醫院腫瘤研究所病因及癌變研究室主任,癌發生及預防分子機理北京市重點實驗室主任;北京協和醫學院學術委員會委員,北京大學醫學部學術委員會委員,分子腫瘤學國家重點實驗室學術委員。1986年北京醫科大學研究生畢業。1988年8月至1990年6月先后在法國國家科學研究中心腫瘤研究所和世界衛生組織國際癌癥研究中心(IARC),1990年7月至1994年8月在美國國家毒理學研究中心分子流行病學研究室從事腫瘤基礎研究。1995到腫瘤醫院腫瘤研究所工作。國家杰出青年科學基金獲得者(1998年);衛生部有突出貢獻中青年專家(2003-2004年度);國務院頒發政府特殊津貼專家(2001年)。

        學術兼職:中國抗癌協會理事、腫瘤病因專業委員會主任委員,中國吸煙與健康協會理事;國際專業期刊《Cancer Epidemiology Biomarkers & Prevention》、《Pharmacogenetics and Genomics》、《Biomedical and Environmental Sciences》,國內專業期刊《中華腫瘤雜志》、《腫瘤防治雜志》、《癌癥》、《腫瘤研究與臨床》、《醫學分子生物學雜志》、《癌變畸變突變》編委。研究領域:常見腫瘤發生發展及其遺傳易感性的分子機制;腫瘤分子流行病學;個體化醫學。曾承擔和正在承擔國家“973”重大基礎研究規劃、國家“863”高技術項目、國家自然科學基金重大項目、國家自然科學基金重點項目、國家杰出青年科學基金項目、國家醫學科技攻關項目、國家自然科學基金項目、北京市科委重大項目、教育部跨世紀優秀人才基金項目、海外青年學者合作研究項目等重要的科研項目。
        主要學術貢獻:較系統地研究了致癌物代謝、DNA修復、細胞周期和凋亡控制、腫瘤免疫等系統的基因遺傳變異與肺癌、食管癌、胃癌、乳腺癌、結-直腸癌等常見腫瘤發生和發展的關系。至今已發表研究論文140多篇,其中發表在包括Nat Genet,J Exp Med,JNCI,Gastroenterology,Cancer Res等著名或重要的國際專業期刊的論文120多篇,全部論文被引用3000余次。研究成果獲2006年國家自然科學獎二等獎、2008年國家科技進步獎二等獎。發表在Nature Genetics的文章(Sun et al, 2007;39:605–613)被評為2007年度中國基礎研究十大新聞。培養的博士研究生已有3人獲全國優秀博士學位論文。

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