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基因組純化之Promega篇 多樣化的選擇[選購(gòu)寶典]
【字體: 大 中 小 】 時(shí)間:2011年05月26日 來(lái)源:生物通
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生物通小編這次就帶大家巡一巡眾多品牌的基因組DNA純化產(chǎn)品,并教大家如何挑選適合自己的純化產(chǎn)品。 第一站是Promega。關(guān)于基因組DNA的純化,Promega提供了豐富的產(chǎn)品。若是一一介紹,恐怕大家看了更暈。那么,生物通先給大家介紹兩款經(jīng)典產(chǎn)品,然后再?gòu)牟煌瑯悠奉愋腿胧郑⒔Y(jié)合樣品起始量和通量,分別介紹最新產(chǎn)品。
第一站我們要介紹的是Promega公司。在生物技術(shù)這個(gè)年輕的領(lǐng)域中,Promega公司進(jìn)駐中國(guó)已有26年的歷史,可不是一般的長(zhǎng)。而且,相對(duì)于其他進(jìn)口品牌,該公司產(chǎn)品價(jià)格親民。在物價(jià)飛漲的今天,這一點(diǎn)更是難能可貴。
回到正題,關(guān)于基因組DNA的純化,Promega提供了豐富的產(chǎn)品。若是一一介紹,恐怕大家看了更暈。那么,生物通先給大家介紹兩款經(jīng)典產(chǎn)品,然后再?gòu)牟煌瑯悠奉愋腿胧郑⒔Y(jié)合樣品起始量和通量,分別介紹最新產(chǎn)品。
經(jīng)典產(chǎn)品之一:Wizard® 基因組DNA純化試劑盒
此試劑盒是基于經(jīng)典的沉淀法,可從全血、組織培養(yǎng)細(xì)胞、動(dòng)物及植物組織、酵母、革蘭氏陽(yáng)性及革蘭氏陰性細(xì)菌中提取基因組DNA,純化方法簡(jiǎn)單、快速。
操作過(guò)程也是經(jīng)典的4步。首先是裂解細(xì)胞和細(xì)胞核。對(duì)于全血的DNA提取,這一步則包括裂解紅細(xì)胞,接著裂解白細(xì)胞和細(xì)胞核。如果需要,在這一步可加入RNase消化。接著通過(guò)鹽沉淀步驟去除胞內(nèi)蛋白。之后,通過(guò)異丙醇沉淀濃縮基因組DNA,并通過(guò)乙醇洗滌。純化得到的DNA可用于擴(kuò)增反應(yīng)、限制性酶切消化和膜雜交等多種應(yīng)用。
這一試劑盒能夠勝任多種材料,對(duì)樣品的起始量要求也很廣。以全血為例,低至50 μl,高至10 ml都OK。因此,的確是實(shí)驗(yàn)室的不錯(cuò)選擇。價(jià)格方面,500次(每次300 μl全血)試劑盒的價(jià)格為2,742元,單次不到5.5元。
采用Wizard® 基因組DNA純化試劑盒從不同起始材料中純化DNA的產(chǎn)量如下:
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來(lái)源 |
起始樣品量 |
DNA產(chǎn)量 |
|
全血 |
300 μl |
5-15 μg |
|
1 ml |
25-50 μg | |
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10 ml |
250-500 μg | |
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96孔板,50 μl/孔 |
0.2-0.7 μg | |
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組織培養(yǎng)細(xì)胞 |
106-107細(xì)胞 |
5-30 μg |
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鼠肝 |
11 mg |
15-20 μg |
|
鼠尾 |
0.5 |
10-30 μg |
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昆蟲(chóng)細(xì)胞 |
5×106細(xì)胞 |
16 μg |
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植物葉組織 |
40 mg |
7-12 μg |
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細(xì)菌培養(yǎng)液 |
108-1010細(xì)胞 |
5-20 μg |
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酵母 |
1.9×108細(xì)胞 |
4.5-6.5 μg |
經(jīng)典產(chǎn)品之二:Wizard® Magnetic 96 食品DNA 純化系統(tǒng)
此系統(tǒng)可從多種天然和加工食物中純化出DNA,包括谷物種子、谷物粉、大豆、大豆粉和豆奶、薯片、巧克力及含巧克力的食品、蛋黃和植物油等。從這些樣品中純化出的DNA 可用于轉(zhuǎn)基因作物(GMO)的序列測(cè)定。
純化過(guò)程使用了MagneSil® 順磁性顆粒,僅需極少的離心,也不需有機(jī)溶劑抽提,快速簡(jiǎn)便,僅用常規(guī)方法1/3 的時(shí)間即可完成。此試劑盒的價(jià)格為13,203元/400次。
除了這兩個(gè)經(jīng)典產(chǎn)品,Promega近幾年也推出了不少新產(chǎn)品,可滿足你的“三高”要求——純度高、產(chǎn)量高、通量高。生物通將按照樣品類型一一介紹。
組織
我們都知道,若DNA樣品有酒精殘留,可能會(huì)抑制下游的酶解反應(yīng)。為解決這一問(wèn)題,Promega推出了ReliaPrep™ 組織基因組DNA小提系統(tǒng)。它提供了完整即用的方法,可從高達(dá)25mg組織、1個(gè)口腔拭子、或1cm的剪斷鼠尾中純化得到高純度的gDNA。整個(gè)操作過(guò)程僅需30分鐘或更短,無(wú)需酒精洗滌或沉淀即可得到完整的gDNA,適合基因分型、芯片和測(cè)序等苛刻應(yīng)用。
這個(gè)試劑盒采用的是柱提法,也是簡(jiǎn)單的4步。首先破碎起始材料,釋放DNA;然后讓DNA與ReliaPrep™結(jié)合柱結(jié)合;利用洗滌液去除雜質(zhì);最后是洗脫。不過(guò)此洗滌液不同于以往的70%乙醇,也就避免了乙醇?xì)埩羲鶐?lái)的問(wèn)題。此外,系統(tǒng)中的試劑都以即用型提供,無(wú)需添加或配制。
血液
Promega提供了ReliaPrep™、Wizard®以及Maxwell® 三個(gè)系列的gDNA純化試劑盒,能夠從哪怕最具挑戰(zhàn)性的血液樣品中提取基因組DNA。前面提到的經(jīng)典產(chǎn)品Wizard® 基因組DNA純化試劑盒就能從50 μl–10 ml全血中提取gDNA。
若血液量較少,你還可以試試ReliaPrep™血液基因組DNA小提系統(tǒng)。它的特點(diǎn)同上,無(wú)需酒精洗滌,即可從多達(dá)200μl血液或體液中始終如一地提取到純凈的完整基因組DNA。基因組DNA可以從新鮮的或冷凍的血液中制備,在不到40分鐘內(nèi)可得到4–10μg的預(yù)期DNA產(chǎn)量,當(dāng)然這取決于血液樣品中的白細(xì)胞數(shù)目。
若血液量較多,ReliaPrep™大容量高通量gDNA提取系統(tǒng)則更為合適。它能以規(guī)格可調(diào)的模式從3-10ml血樣中提取基因組DNA。該方法無(wú)需繁瑣的離心步驟,也無(wú)需使用有毒試劑,而這些是沉淀提取法所固有的。ReliaPrep™大容量高通量gDNA提取系統(tǒng)已在Hamilton Robotics MICROLAB® STARplus液體處理工作站中實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化,可以一次性處理96個(gè)樣品。對(duì)于一次最多32個(gè)樣品的低通量gDNA提取,可以使用ReliaPrep™ 32 LV HSM的手動(dòng)模式,由用戶手動(dòng)進(jìn)行移液。
上面介紹的這些產(chǎn)品大部分采用手動(dòng)操作來(lái)提取gDNA。隨著人們對(duì)速度、質(zhì)量的要求不斷提高,有些實(shí)驗(yàn)室也開(kāi)始嘗試使用自動(dòng)化的純化系統(tǒng)。Maxwell® 16儀器便是Promega公司近年來(lái)推出的一款純化儀。
Maxwell® 16儀器可自動(dòng)純化高質(zhì)量DNA、RNA、病毒總核酸和重組蛋白,均衡性好,省時(shí)省力,可滿足多種下游應(yīng)用。純化的介質(zhì)為順磁性顆粒,能夠?qū)崿F(xiàn)對(duì)目標(biāo)分子的最佳捕獲、洗滌以及洗脫。與傳統(tǒng)的硅膠膜方法相比,磁珠帶來(lái)了更高的結(jié)合量和更干凈的洗脫。將樣品或樣品裂解物直接加入預(yù)先裝有試劑的試劑筒內(nèi),即可按“開(kāi)始”鍵,啟動(dòng)純化程序。試劑盒與自動(dòng)純化程序均經(jīng)過(guò)優(yōu)化,能夠從特定樣品中純化出最高質(zhì)量的目標(biāo)用于下游實(shí)驗(yàn)。
Maxwell®16自動(dòng)純化儀有兩種配置可供選購(gòu):用于得到最大產(chǎn)量的SEV (Standard Elution Volume,標(biāo)準(zhǔn)洗脫體積,200-400μl),和用于得到最高濃度的LEV(Low Elution Volume,低洗脫體積,30-100μl)。此外,SEV和LEV儀器均可配置Flexi Method 固件,用戶可以自行構(gòu)建Maxwell® 16自動(dòng)純化儀的程序,做進(jìn)一步的性能優(yōu)化。
Maxwell® 16自動(dòng)純化儀預(yù)置有純化程序,試劑盒內(nèi)有預(yù)先裝有各步驟試劑的條形試劑筒,這些程序與試劑盒最大限度地增加了操作的簡(jiǎn)便程度。在18-50分鐘內(nèi)(取決于樣品的類型),該自動(dòng)純化儀可處理1-16個(gè)樣品。有了Maxwell® 16,你就可以有更多時(shí)間去完成其他更具創(chuàng)造性的工作。
目前,Promega提供了以下試劑盒,可用于Maxwell® 16自動(dòng)純化儀。
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名稱 |
用途 |
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從血液中自動(dòng)化提取DNA(低洗脫體積) | |
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從血液中自動(dòng)化提取DNA | |
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從細(xì)胞中自動(dòng)化提取DNA | |
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從組織中自動(dòng)化提取DNA | |
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從鼠尾中自動(dòng)化提取DNA | |
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從FFPE樣品中自動(dòng)化提取DNA(低洗脫體積) | |
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從細(xì)胞中自動(dòng)化提取DNA(低洗脫體積) | |
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從血清、血漿或其他樣品中自動(dòng)化提取病毒總核酸 | |
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從口腔拭子中自動(dòng)化提取DNA | |
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從FFPE樣品中自動(dòng)化提取DNA(低洗脫體積) | |
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從3-10ml血樣中提取基因組DNA |
若您對(duì)于選擇什么樣的純化產(chǎn)品還是心里沒(méi)底,那么可以登陸Promega英文網(wǎng)站。它上面有個(gè)小工具—核酸純化產(chǎn)品選擇器,通過(guò)幾個(gè)簡(jiǎn)單的問(wèn)答(如樣品量和通量),就可以推薦適合的產(chǎn)品,相當(dāng)方便。當(dāng)然,你也可以點(diǎn)擊此處索取gDNA純化的相關(guān)資料。(生物通 余亮)
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