
-
生物通官微
陪你抓住生命科技
跳動的脈搏
飛一般的DNA甲基化檢測[新品推薦]
【字體: 大 中 小 】 時間:2011年04月27日 來源:生物通
編輯推薦:
默克密理博公司近日推出一款極速重亞硫酸鹽處理試劑盒(CpGenome™ Turbo Bisulfite Modification Kit),讓你體驗極為快速的重亞硫酸鹽轉化。此款試劑盒不僅能提高實驗速度,還能保證檢測的靈敏度和轉化效果。
近年來,表觀遺傳學逐漸成為生命科學研究中的熱點,而DNA甲基化作為表觀遺傳學中的重要組成部分,研究熱度也持續升溫。DNA甲基化是最早發現的基因表觀修飾方式之一,可能存在于所有高等生物中。它參與了動物胚胎發育、遺傳印跡和X染色體失活等過程,在基因表達的調控中具有重要作用,異常的DNA甲基化則可導致腫瘤等多種疾病的形成。
隨著對DNA甲基化研究的不斷深入,各種各樣的DNA甲基化檢測方法被開發出來,以滿足不同類型研究的要求。這些方法包括甲基化敏感的限制性內切酶、基因組DNA測序、甲基化特異PCR等等。對于后兩種方法,研究的第一步就是開展重亞硫酸鹽(bisulfite)處理。重亞硫酸鹽將未甲基化的胞嘧啶轉化成尿嘧啶,于是能區分出甲基化位點,再結合測序或PCR等方法來檢測。
俗話說,好的開始是成功的一半,重亞硫酸鹽處理這一步對實驗的成敗至關重要。然而,經典的重亞硫酸鹽處理方法存在諸多缺陷。操作相當繁瑣,耗時又費力。至于轉化效率,就更難把握,有些轉化不完全,直接造成假陽性結果,有些則會出現過度轉化,影響檢測的靈敏度,經常是忙了半天卻沒結果。
為此,默克密理博公司近日推出一款極速重亞硫酸鹽處理試劑盒(CpGenome™ Turbo Bisulfite Modification Kit),讓你體驗極為快速的重亞硫酸鹽轉化。此款試劑盒不僅能提高實驗速度,還能保證檢測的靈敏度和轉化效果。
體驗極速轉化
使用這一款極速重亞硫酸鹽處理試劑盒,從DNA樣品處理到轉化后的高純DNA只需90分鐘,而傳統的重亞硫酸鹽處理需要18個小時,市場上其他試劑盒也大概需要6個小時。為何如此之快?默克密理博的秘密就是他們的一款受專利保護的處理試劑,能在很短時間內將未甲基化的胞嘧啶徹底轉化。同時這種試劑對DNA的傷害又極小,不像通常的高鹽、高溫以及低pH等極端條件會導致DNA高度片段化。至于這種處理試劑的成分,我們當然無從得知,只知道它是由兩種試劑混合而成。有了它,轉化即可在40分鐘內完成,耗時僅為其他方法的1/10。
速度與效果、靈敏度并存
也許你又有點擔心轉化的效果,快是快了,但會不會轉化不完全呢?其實,這款試劑盒的修飾轉化效率高達99.9%。不信,請看圖1。1 ng基因組DNA用極速重亞硫酸鹽處理試劑盒處理后,再用CpG Wiz® MGMT引物對進行定量PCR。結果顯示,極速重亞硫酸鹽處理試劑盒在更短的時間內達到與其他同類商業化產品一樣的結果。


圖1. 出色的效果,雙倍的速度。1 ng基因組DNA分別用極速重亞硫酸鹽處理試劑盒和Z品牌的試劑盒處理后,再用CpG Wiz® MGMT引物對進行定量PCR。極速重亞硫酸鹽處理試劑盒的時間是Z品牌試劑盒消耗時間的一半。而兩者效果則相近。
避免過度轉化
有時,過度轉化也是一個大問題。不過,極速重亞硫酸鹽處理試劑盒可有一雙雪亮的眼睛,只會徹底轉化非甲基化的胞嘧啶,而絲毫不會轉化甲基化的胞嘧啶!研究人員做過實驗,用極速重亞硫酸鹽處理試劑盒處理甲基化DNA(藍字)和非甲基化DNA(綠字),然后用CpG Wiz® MGMT引物對進行測序。結果顯示,在所有檢測的樣本中,極速重亞硫酸鹽處理試劑盒僅特異地徹底地轉化了非甲基化胞嘧啶,而完全沒有轉化甲基化胞嘧啶(圖2)。這個特點最大限度地維護了我們實驗結果的真實性和準確性。

圖2. 無過度轉化。
表現始終如一
無論是1 ng DNA,還是1 μg DNA樣品,極速重亞硫酸鹽處理試劑盒都一視同仁,產生靈敏且可靠的重亞硫酸鹽轉化結果。不同量的甲基化DNA用極速重亞硫酸鹽處理試劑盒處理后,用50 μl(1 μg和100 ng樣品)或25 μl(10 ng和1 ng樣品)洗脫液洗脫后,用CpG Wiz MGMT甲基化引物對進行定量PCR,然后比較轉化結果。如圖3所示,從1 ng到1 μg DNA樣品均有可靠的轉化結果。

圖3. 從1 ng到1 μg DNA樣品均有靈敏且可靠的重亞硫酸鹽轉化結果。
針對上游的甲基化DNA富集,默克密理博還推出了配套使用的甲基化DNA富集試劑盒(CpG MethylQuest™ DNA Isolation Kit),能簡單、高效、快速地富集甲基化DNA。它采用GST-MBD2b蛋白預包被的磁珠來富集甲基化DNA,簡單又快速,只需2小時即可完成。CpG MethylQuest MBD蛋白特異性結合甲基化DNA,而不與非甲基化或半甲基化DNA結合,保證了結果的特異性。
此外,默克密理博還提供豐富的表觀遺傳學研究工具,包括染色質免疫沉淀ChIP試劑盒、RNA免疫沉淀RIP試劑盒、端粒酶檢測試劑盒和多種表觀遺傳學抗體等,為大家提供了表觀遺傳學的整體解決方案。如果你有表觀遺傳學方面的任何問題,歡迎登陸生物通和默克密理博共同打造的表觀遺傳學論壇。那里潛伏著很多高手,為你解惑答疑,也有豐富的資源,供你學習下載。
關于默克密理博(Merck Millipore)
推進21世紀生命科學的發展是默克與密理博共同的目標和承諾。 2010年7月15日默克集團成功并購密理博公司,成立了一個新的默克密理博部門,為全球生命科學用戶提供完整的產品線和強大的創新能力,共同打造生命科學行業內的一個世界級的合作伙伴。默克密理博的研發能力和投資也將躍居該行業的前三位,將更有實力研發更多創新產品。
新成立的默克密理博部門將繼續為“推動生命科學的發展”而努力。由于兩個公司原來的產品線僅有小部分重疊,合并后的公司將擁有更寬廣的產品線和專業技術,能為全球的生物科學和生物制藥用戶提供更全面,更專業的產品和解決方案。新的部門將有3個業務部門組成:實驗室解決方案部(包含實驗室基礎,實驗室純水和生物監測等業務組),生物科學部(包含生命科學和研發解決方案業務組)和過程方案部 (生物醫藥過程業務組和醫藥化學業務組)
Unleash the Potential of Science for Life