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        小分子RNA研究方案 ABI拓展SOLiD在基因表達研究的應用[創新技巧]

        【字體: 時間:2008年04月30日 來源:生物通

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          SOLiD RNA表達解決方案進一步拓展ABI新一代測序平臺的高靈敏數據化基因表達分析解決方案。新產品包括一個全新的樣品制備試劑盒,可實現在無需預先知道序列信息的情況下高通量發現新的RNA分子。樣品制備工作從常規方法的四天(其他平臺)縮短為僅需一天,因而有望促進研究人員改進與小分子RNA相關的生物學變化的檢測。它也僅需極少量的樣品,使過去因為RNA樣本量不足而無法用其他方法進行分析的研究,如今借助SOLiD也得以開展研究。

        ABI供稿 生物通翻譯

            生物通報道:就在近幾年,科學家才開始逐漸了解非蛋白質編碼的小分子RNA在活細胞中的作用。科學和技術的突破表明,這類新發現的調節分子在細胞生理過程中起到關鍵作用,有助于深入理解基本的生物學和諸如癌癥等復雜疾病過程。現在,來自Applera集團旗下的ABI公司(Applied Biosystem)為研究人員提供了基于ABI新一代基因組分析技術的全新研究工具,用于發現microRNA和其它小分子RNA。

            ABI公司今天宣布推出全新SOLiD RNA表達解決方案,進一步拓展ABI新一代測序平臺的高靈敏數據化基因表達分析解決方案。新產品包括一個全新的樣品制備試劑盒,可實現在無需預先知道序列信息的情況下高通量發現新的RNA分子。這個方案有望顯著地提高研究人員鑒別小分子RNA的能力,將過去不可能完成的實驗變為可能。

            SOLiD小分子RNA表達試劑盒(SOLiD Small RNA Expression Kit)為研究人員提供了一種全新的工作流程,能極大地減少小分子RNA庫制備過程所需的時間、成本和實驗偏差。這個試劑盒將總RNA轉換為適于插入SOLiD System工作流程的文庫,以便進行高通量的基因組分析。這種簡單的實驗方法,可將樣品制備工作從常規方法的四天(其他平臺)縮短為僅需一天,因而有望促進研究人員改進與小分子RNA相關的生物學變化的檢測。它也僅需極少量的樣品,使過去因為RNA樣本量不足而無法用其他方法進行分析的研究,如今借助SOLiD也得以開展研究。這個新的樣品制備試劑盒目前可以通過“優先使用計劃”獲得。

            一旦用SOLiD系統發現了小分子RNA,研究人員就可以使用ABI業界領先的TaqMan(R) Assays來驗證研究結果,或者集中研究感興趣的特定microRNAs。ABI提供microRNA分析的完整工作流程解決方案。ABI幾天前也宣布,它已經啟動Custom TaqMan MicroRNA Assays的“優先使用計劃”,以幫助研究客戶發現新的microRNAs。

            馬薩諸塞大學醫學院教授Vitor Ambros博士致力于小分子RNA研究的前沿領域,他是到目前為止優先使用SOLiD Small RNA Expression試劑盒的十幾個用戶之一。Ambros博士將這個試劑盒和TaqMan microRNA Assays聯合使用,研究microRNA在癌癥中的作用。

            “這是一項真正的革新性技術。它讓科學家能夠以前所未有的簡單方式進行之前無法想象的實驗”,Ambros博士說,“據我個人的經驗,與我過去用過的技術相比,這個試劑盒所需的單個樣品量至少要少10倍,實驗操作步驟也少得多。今后,這種簡單直接的方法將使更多的科學家得以進行這些類型的研究”。

            目前已發現的microRNAs還不到800個,但技術的進步----例如SOLiD System,有望揭示更多新的有科研價值的小分子。因為SOLiD System可在不知道目標分子DNA序列的情況下進行檢測和定量小的RNA分子,所以它是分析在生物樣品中表達的已知和未知miRNA及其它小分子RNAs的有效工具。

            “SOLiD System是基因表達分析的完美之選,因為它提供了業界最高檢測通量,擁有檢測低水平表達的基因和檢測低豐度分子的變化所需的高靈敏度”,ABI公司SOLiD基因表達策略的主管Roland Wicki說,“有了這個新的小分子RNA表達試劑盒,我們就可以將SOLiD系統的基因表達分析之應用范圍擴展到所知甚少但又極其重要的小分子RNA上”。

            ABI是全球生命科學市場儀器系統、消耗品、軟件和服務等方面研發和銷售的領頭企業,公認商業化DNA測序平臺的市場領導者。ABI為非編碼RNA的研究提供最全面的解決方案,產品包括小分子RNA的發現、表達分析和定量,以及siRNA進行基因敲除、敲除驗證和樣品制備等。ABI通過不斷將其先進的技術商品化應用以幫助科學家在基因組信息基礎上更好地了解和治療疾病,從而繼續保持在DNA測序領域的領袖地位。SOLiD系統在高通量、精確性、應用靈活性和延展性方面為新一代遺傳分析平臺建立新標準。

            SOLiD System是一個端到端的新一代基因組研究方案,包含測序組件、化學組件、計算集群和數據存儲組件。這個平臺基于通過寡核苷酸連接和檢測進行測序。與聚合酶測序方法不同的是,SOLiD System利用專利的逐步連接(stepwise ligation)技術來產生高質量的數據,可應用于全基因組測序、染色質免疫共沉淀(ChIP)、微生物測序、數字核型分析、臨床測序、基因型分析、基因表達分析和小分子RNA的發現等等。

        關于Applera公司和ABI
            Applera公司有2個部分組成,ABI通過開發和銷售儀器系統,消耗品,軟件和服務來服務于生命科學產業和研究團體。客戶采用這些工具來分析核酸,小分子,和蛋白質來進行科學研究和開發新的藥物。ABI產品也包括服務部分生命科學研究以外的一些市場的需求,即應用市場,包括人類基因鑒定(法醫物證和親子鑒定),生物安全(包括響應生物恐怖主義和其他惡意威脅,意外和自然生物災害),質量和安全鑒定(如食物和藥物生產的鑒定)。ABI總部位于加州Forster市,2007財政年度報告銷售額達到接近21億美元。Celera集團則致力于診斷市場,開發個性化疾病治療方案的一系列產品和服務。Berkeley HeartLab是Celera的一個分支,提供心臟病風險預測服務和病人治療方案優化。Celera也通過戰略合作伙伴如雅培公司提供一系列分子診斷產品,或者授權其他診斷技術開發以提供癌癥和肝臟疾病的個性化疾病治療方案。詳細信息請訪問www.applera.com. 有關ABI公司信息請訪問www.appliedbiosystens.com.


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