10x 學(xué)習(xí)中心
新手指南讓您信心滿滿地開(kāi)展單細(xì)胞RNA-seq
為了追求更好的科學(xué)研究，您需要更好的數(shù)據(jù)，而單細(xì)胞方法提供了其他方法無(wú)法比擬的高分辨率見(jiàn)解。我們的學(xué)習(xí)中心介紹了這一變革性的研究工具，讓更多研究人員能夠開(kāi)展更具影響力的研究。
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新手指南讓您信心滿滿地開(kāi)展單細(xì)胞RNA-seq
為了追求更好的科學(xué)研究，您需要更好的數(shù)據(jù)，而單細(xì)胞方法提供了其他方法無(wú)法比擬的高分辨率見(jiàn)解。我們的學(xué)習(xí)中心介紹了這一變革性的研究工具，讓更多研究人員能夠開(kāi)展更具影響力的研究。
什么是單細(xì)胞RNA測(cè)序？
單細(xì)胞RNA測(cè)序（scRNA-seq）技術(shù)測(cè)定單個(gè)細(xì)胞的全轉(zhuǎn)錄組基因表達(dá)，有助于詳細(xì)了解細(xì)胞在復(fù)雜組織中如何發(fā)揮功能和相互作用。通過(guò)追蹤單個(gè)轉(zhuǎn)錄本的來(lái)源細(xì)胞，研究人員能夠在高度異質(zhì)的樣本中找出獨(dú)特的基因表達(dá)譜，最終揭示出其他方法經(jīng)常遺漏的稀有細(xì)胞類(lèi)型和動(dòng)態(tài)細(xì)胞狀態(tài)。例如，研究人員在利用批量細(xì)胞RNA-seq（測(cè)定大量細(xì)胞的基因表達(dá)平均值）分析一種致命的腫瘤時(shí)，可能會(huì)漏掉一小部分對(duì)治療耐藥的細(xì)胞，從而忽略了潛在的藥物靶點(diǎn)。
單細(xì)胞分析能夠?yàn)槲业难芯孔鲂┦裁矗?/p>
10x Genomics是單細(xì)胞研究領(lǐng)域公認(rèn)的引領(lǐng)者，通過(guò)優(yōu)化的方案、端對(duì)端的支持和易用的分析工具擴(kuò)大了單細(xì)胞分析的范圍。以10年經(jīng)驗(yàn)、2200多項(xiàng)專利和超過(guò)15億美元的研發(fā)投資作為后盾，我們的技術(shù)幫助研究人員發(fā)表了8000多篇研究論文，其中許多應(yīng)用實(shí)例展示了我們工具的高影響力。
繪制健康和病變組織的全面單細(xì)胞多組學(xué)圖譜，以鑒定疾病特異性的細(xì)胞或細(xì)胞狀態(tài)。
捕捉樣本中數(shù)千個(gè)至數(shù)百萬(wàn)個(gè)細(xì)胞的完整異質(zhì)性。
追蹤細(xì)胞狀態(tài)隨時(shí)間的變化，以描繪發(fā)育通路、疾病進(jìn)展和免疫反應(yīng)。
探索腫瘤微環(huán)境等生態(tài)位中淋巴細(xì)胞與目標(biāo)細(xì)胞之間的相互作用。
高的細(xì)胞回收率，以及對(duì)稀有轉(zhuǎn)錄本和RNA含量較低細(xì)胞的靈敏檢測(cè)，讓您對(duì)數(shù)據(jù)充滿信心，而以往通過(guò)已知標(biāo)志物很難捕捉或檢測(cè)這些轉(zhuǎn)錄本和細(xì)胞。
看看單細(xì)胞分析發(fā)揮了哪些強(qiáng)大的多樣化功能
看看全世界的研究人員如何使用10x Genomics的Chromium單細(xì)胞分析來(lái)回答各個(gè)研究領(lǐng)域的緊迫問(wèn)題。
觀看視頻單細(xì)胞RNA-seq有哪些優(yōu)勢(shì)？
| 單細(xì)胞RNA測(cè)序 | 批量細(xì)胞RNA測(cè)序 | 微陣列 | 流式細(xì)胞術(shù) | IHC 或 IF | |
|---|---|---|---|---|---|
| 好處 |
單細(xì)胞分辨率的全轉(zhuǎn)錄組分析，而不是平均化的群體數(shù)據(jù) 以高分辨率見(jiàn)解捕捉稀有細(xì)胞類(lèi)型和動(dòng)態(tài)細(xì)胞狀態(tài) 通過(guò)更高的靈敏度發(fā)現(xiàn)新的基因、細(xì)胞類(lèi)型或稀有群體 |
樣本水平的全轉(zhuǎn)錄組分析，提供大量細(xì)胞的平均基因表達(dá)數(shù)據(jù) 因數(shù)據(jù)復(fù)雜度和分辨率較低，工作流程和數(shù)據(jù)分析更簡(jiǎn)單 測(cè)序深度和成本較低，側(cè)重于群體水平的見(jiàn)解 |
定量感興趣的特定基因的表達(dá)水平 同時(shí)檢測(cè)數(shù)千個(gè)基因的表達(dá)情況 良好的驗(yàn)證工具 對(duì)大規(guī)模研究而言具有成本效益 |
同時(shí)測(cè)定多個(gè)標(biāo)記 每秒對(duì)數(shù)千個(gè)細(xì)胞進(jìn)行高通量分析 每次實(shí)驗(yàn)的成本很低 |
只需少量試劑即可完成的經(jīng)濟(jì)操作 在組織背景下檢測(cè)基因表達(dá) |
| 挑戰(zhàn) |
人們普遍認(rèn)為與批量分析相比成本較高 通常需要專業(yè)的分析 需要深度測(cè)序來(lái)捕捉稀有特征 |
群體平均值掩蓋了細(xì)胞異質(zhì)性 低分辨率限制了對(duì)稀有或新細(xì)胞群的檢測(cè) 靈敏度低導(dǎo)致低水平轉(zhuǎn)錄本被遺漏 需要專門(mén)的軟件分析工具 |
群體平均結(jié)果掩蓋了細(xì)胞異質(zhì)性 需要提前了解感興趣的基因 單次實(shí)驗(yàn)成本高 靈敏度低，動(dòng)態(tài)范圍小 |
僅限于預(yù)定義的細(xì)胞類(lèi)別，由已知的 需要昂貴的專業(yè)設(shè)備，維護(hù)成本可能很高 復(fù)雜樣本的數(shù)據(jù)分析具有挑戰(zhàn)性 |
抗體的特異性可能發(fā)生變化（染色可能是非特異性的），通常需要抗體驗(yàn)證 結(jié)果的定量可能具有挑戰(zhàn)性 作為多步驟程序中的一部分，需要昂貴的設(shè)備 |
單細(xì)胞RNA測(cè)序?qū)槟难芯繋?lái)哪些獨(dú)特好處？
了解單細(xì)胞方法與您熟知的方法之間的共通之處，同時(shí)還提供了這些方法可能遺漏的更高分辨率的見(jiàn)解。
我要詢價(jià)單細(xì)胞分析如何在不增加復(fù)雜度或成本的情況下提升我的研究？
現(xiàn)在有了10x Genomics，單細(xì)胞研究比以往任何時(shí)候都更容易實(shí)現(xiàn)。我們的端對(duì)端平臺(tái)簡(jiǎn)化了從樣本制備到數(shù)據(jù)分析的每一步，能夠快速經(jīng)濟(jì)地提供高影響力的結(jié)果。作為可靠的引領(lǐng)者，我們確保無(wú)與倫比的數(shù)據(jù)質(zhì)量，避免您錯(cuò)過(guò)關(guān)鍵發(fā)現(xiàn)，從而保護(hù)您的樣本和預(yù)算。
1.常見(jiàn)的誤區(qū)：單細(xì)胞分析很昂貴
10x Genomics Chromium單細(xì)胞分析的真實(shí)情況
Chromium單細(xì)胞分析可以根據(jù)您的預(yù)算進(jìn)行定制，且不會(huì)犧牲性能
對(duì)于新用戶而言，尤其是那些使用大量樣本的用戶，成本往往是主要障礙。但每個(gè)樣本的成本低并不一定意味著長(zhǎng)遠(yuǎn)的成本節(jié)約。如果沒(méi)有高分辨率，您可能會(huì)錯(cuò)過(guò)一種新的細(xì)胞類(lèi)型或一條低表達(dá)的轉(zhuǎn)錄本，而這些對(duì)您推進(jìn)項(xiàng)目（或在高影響力期刊上發(fā)表文章）至關(guān)重要。
有了10x Genomics，您能夠獲得更好的數(shù)據(jù)，減少錯(cuò)誤，并有信心在第一次就做好。
以每個(gè)樣本比此前更低的成本，您能夠獲得其他單細(xì)胞方法無(wú)法比擬的高分辨率結(jié)果，尤其是高達(dá)95%的可用讀數(shù)，讓您能夠以更低的測(cè)序成本檢測(cè)更多的基因。數(shù)據(jù)越多并不意味著越復(fù)雜——我們免費(fèi)的分析流程無(wú)需任何生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn)。此外，由1,000多家核心實(shí)驗(yàn)室組成的全球網(wǎng)絡(luò)讓您輕松上手，最大限度地減少您的投資和風(fēng)險(xiǎn)。
2.常見(jiàn)的誤區(qū)：單細(xì)胞分析只適用于新鮮樣本
10x Genomics Chromium單細(xì)胞分析的真實(shí)情況
Chromium單細(xì)胞分析能夠分析新鮮、冷凍和固定樣本，甚至是FFPE樣本
Chromium平臺(tái)能夠自信地應(yīng)對(duì)各種研究問(wèn)題，它附帶40多個(gè)示范方案，性能可靠，適用于新鮮、冷凍和固定樣本，甚至是FFPE樣本。
與Chromium單細(xì)胞分析兼容的樣本類(lèi)型：
3.常見(jiàn)的誤區(qū)：單細(xì)胞工作流程復(fù)雜又耗時(shí)
10x Genomics Chromium單細(xì)胞分析的真實(shí)情況
我們久經(jīng)考驗(yàn)的工作流程很簡(jiǎn)單，通過(guò)自動(dòng)化最大限度減少了手動(dòng)操作時(shí)間
每個(gè)實(shí)驗(yàn)都可以分解為幾個(gè)關(guān)鍵步驟：樣本制備、運(yùn)行檢測(cè)和數(shù)據(jù)分析——scRNA-seq也不例外。我們優(yōu)化的方案、可靠的性能、儀器方面的支持以及直觀的分析流程讓任何用戶都能使用scRNA-seq，無(wú)論其經(jīng)驗(yàn)水平如何。
我們的自動(dòng)化流程讓您充滿信息，提供卓越的可重復(fù)性并節(jié)省時(shí)間
我們將單細(xì)胞工作流程中最關(guān)鍵的步驟自動(dòng)化，能在幾分鐘內(nèi)生成數(shù)千個(gè)細(xì)胞的微滴，只需3-4小時(shí)的手動(dòng)操作，最大限度減少手動(dòng)操作中移液帶來(lái)的誤差。我們的工作流程特有簡(jiǎn)約的按鈕式界面，可通過(guò)核心實(shí)驗(yàn)室輕松訪問(wèn)。
4.常見(jiàn)的誤區(qū)：單細(xì)胞數(shù)據(jù)很難分析——我必須聘請(qǐng)生物信息學(xué)家或與之合作
10x Genomics Chromium單細(xì)胞分析的真實(shí)情況
分析簡(jiǎn)單直觀，無(wú)需專業(yè)知識(shí)
數(shù)據(jù)分析可能很困難，讓人不知所措，尤其是對(duì)不具備生物信息學(xué)經(jīng)驗(yàn)的人來(lái)說(shuō)。我們開(kāi)發(fā)出解決方案來(lái)簡(jiǎn)化這一過(guò)程，利用我們用戶友好的分析工具和流程，研究人員可以更輕松地處理、可視化和探索他們的數(shù)據(jù)。
5.常見(jiàn)的誤區(qū)：采用這項(xiàng)技術(shù)需要大量的技術(shù)培訓(xùn)及其他資源
10x Genomics Chromium單細(xì)胞分析的真實(shí)情況
我們?nèi)娴闹С肿寣?shí)驗(yàn)入門(mén)變得簡(jiǎn)單，為長(zhǎng)久的成功提供保障
10x Genomics的技術(shù)專家在每一步都提供支持，從實(shí)驗(yàn)規(guī)劃到數(shù)據(jù)分析。我們還提供由1,000多家核心實(shí)驗(yàn)室組成的網(wǎng)絡(luò)，以及已發(fā)表8,000多篇論文的研究人員社群，為您提供額外的支持。您并不孤單——我們的內(nèi)部專家、值得信賴的核心實(shí)驗(yàn)室以及蓬勃發(fā)展的研究社群讓您擁有了成功所需的一切。
認(rèn)證服務(wù)商
1,000多家第三方機(jī)構(gòu)（包括經(jīng)過(guò)10x培訓(xùn)和驗(yàn)證的認(rèn)證服務(wù)商）可以為各種研究應(yīng)用提供支持，加速您的研究。
全面的資源覆蓋久經(jīng)考驗(yàn)的工作流程
獲取我們的用戶指南、操作方案、演示視頻和分析指南等，充滿信心地回答您最迫切的研究問(wèn)題，不論樣本類(lèi)型或讀數(shù)如何。
10x目前提供哪些單細(xì)胞分析？
有了10x Genomics，您能做的遠(yuǎn)不止測(cè)定基因表達(dá)。我們的平臺(tái)提供了廣泛的解決方案，讓您能夠分析完整的免疫組庫(kù)，解析染色質(zhì)可及性，并將轉(zhuǎn)錄組學(xué)與蛋白質(zhì)組學(xué)相整合。隨著研究的發(fā)展，10x讓您能夠輕松擴(kuò)展到更高級(jí)的應(yīng)用。下面是我們的產(chǎn)品概覽。
基于逆轉(zhuǎn)錄的全轉(zhuǎn)錄組覆蓋
覆蓋蛋白編碼基因
逐個(gè)細(xì)胞地揭示表觀基因組景觀
